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須田恭之

Suda, Yasuyuki

医学医療系 , 准教授
Institute of Medicine , Associate Professor

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1. Investigating the effects of liquid handling robot pipetting speed on yeast growth and gene expression using growth assays and RNA-seq Taguchi, Shodai; Matsuzawa, Ryosuke; Suda, Yasuyuki; Irie, KenjiOzaki, Haruka
microPublication biology 2025: (2025)
2. The RNA-binding protein Puf5 and the HMGB protein Ixr1 regulate cell cycle-specific expression of CLB1 and CLB2 in Saccharomyces cerevisiae Sato, Megumi; Rana, Varsha; Suda, Yasuyuki; Mizuno, TomoakiIrie, Kenji
PLOS ONE 20: (2025)
3. Remodeling of the secretory pathway is coordinated with de novo membrane formation in budding yeast gametogenesis Suda, Yasuyuki; Tachikawa, Hiroyuki; Suda, Tomomi; Kurokawa, Kazuo (+1 著者) Irie, Kenji
ISCIENCE 27: (2024)
4. Roles of Pbp1, Mkt1, and Dhh1 in the regulation of gene expression in the medium containing non-fermentative carbon sources Himeno, Yurika; Endo, Nozomi; Rana, Varsha; Akitake, Natsu (+3 著者) Irie, Kenji
GENES TO CELLS Epub: (2024)
5. Spatiotemporal dissection of the Golgi apparatus and the ER-Golgi intermediate compartment in budding yeast Tojima, Takuro; Suda, Yasuyuki; Jin, Natsuko; Kurokawa, KazuoNakano, Akihiko
ELIFE 13: (2024) Semantic Scholar
6. Automation of yeast spot assays using an affordable liquid handling robot Taguchi, Shodai; Suda, Yasuyuki; Irie, Kenji; Ozaki, Haruka
SLAS TECHNOLOGY 28: 55 (2022)
7. The RNA-binding protein Puf5 and the HMGB protein Ixr1 contribute to cell cycle progression through the regulation of cell cycle-specific expression of CLB1 in Saccharomyces cerevisiae Sato, Megumi; Irie, Kaoru; Suda, Yasuyuki; Mizuno, TomoakiIrie, Kenji
PLOS GENETICS 18: (2022) Semantic Scholar
8. Regulation of CLB6 expression by the cytoplasmic deadenylase Ccr4 through its coding and 3' UTR regions Revilleza, Jastin; Edrian Cocuangco; Sato, Megumi; Irie, Kaoru (+2 著者) Irie, Kenji
PLOS ONE 17: (2022) Semantic Scholar
9. Suppression of Vps13 adaptor protein mutants reveals a central role for PI4P in regulating prospore membrane extension Nakamura; Tsuyoshi S; Suda, Yasuyuki; Muneshige, Kenji (+10 著者) Tachikawa, Hiroyuki
PLoS genetics 17: e1009727 (2021) Semantic Scholar
10. Pan2-Pan3 complex, together with Ccr4-Not complex, has a role in the cell growth on non-fermentable carbon sources Fujii, Shiori; Duy, Duong Long; Valderrama; Arvin Lapiz (+6 著者) Irie, Kenji
Biochemical and biophysical research communications 570: 125 (2021) Semantic Scholar
11. Pbp1 mediates the aberrant expression of genes involved in growth defect of ccr4∆ and pop2∆ mutants in yeast Saccharomyces cerevisiae Valderrama; Arvin Lapiz; Fujii, Shiori; Duy, Duong Long (+3 著者) Irie, Kenji
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 26: 381 (2021) Semantic Scholar
12. The eIF4E-binding protein Eap1 has similar but independent roles in cell growth and gene expression with the cytoplasmic deadenylase Ccr4 Higuchi, Yudai; Fujii, Shiori; Valderrama; Arvin Lapiz (+3 著者) Irie, Kenji
Bioscience, biotechnology, and biochemistry 85: 1452 (2021) Semantic Scholar
13. Pbp1, the yeast ortholog of human Ataxin-2, functions in the cell growth on non-fermentable carbon sources Tuong Vi; Dang Thi; Fujii, Shiori; Valderrama (+7 著者) Irie, Kenji
PloS one 16: (2021) Semantic Scholar
14. Spatiotemporal dissection of the -Golgi network in budding yeast Tojima, Takuro; Suda, Yasuyuki; Ishii, Midori; Kurokawa, KazuoNakano, Akihiko
Journal of cell science 132: jcs231159 (2019) Semantic Scholar
15. Visualization of secretory cargo transport within the Golgi apparatus Kazuo Kurokawa; Hiroko Osakada; Tomoko Kojidani; Miho Waga (+3 著者) Akihiko Nakano
The Journal of Cell Biology 218: 1602 (2019) Semantic Scholar
16. Pop2 phosphorylation at S39 contributes to the glucose repression of stress response genes, HSP12 and HSP26 Lien, Pham Thi Kim; Viet, Nguyen Thi Minh; Mizuno, Tomoaki; Suda, YasuyukiIrie, Kenji
PloS one 14: (2019) Semantic Scholar
17. Yeast Dop1 is required for glycosyltransferase retrieval from the trans-Golgi network Zhao, Shen-Bao; Suda, Yasuyuki; Nakanishi, Hideki; Wang, Ning (+3 著者) Fujita, Morihisa
Biochimica et biophysica acta. General subjects 1863: 1147 (2019) Semantic Scholar
18. Regulation of LRG1 expression by RNA binding protein Puf5 in the budding yeast cell wall integrity pathway Nguyen, Viet Thi Minh; Duong, Duy Long; Saito, Kazuhiro; Irie, Kaoru (+2 著者) Irie, Kenji
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 23: 988 (2018) Semantic Scholar
19. Regulation of ER-Golgi transport dynamics by GTPases in budding yeast Yasuyuki Suda; Kazuo Kurokawa; Akihiko Nakano
Frontiers in Cell and Developmental Biology 5: 122 (2018) Semantic Scholar
20. Dynamic localization of a yeast development-specific PP1 complex during prospore membrane formation is dependent on multiple localization signals and complex formation Tsuyoshi S. Nakamura; Yumi Numajiri; Yuuya Okumura; Junji Hidaka (+7 著者) Hiroyuki Tachikawa
Molecular Biology of the Cell 28: 3881 (2017) Semantic Scholar

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1. Tsukuba Journal of Medical Science 大庭, 良介; 須田恭之; 入江賢児 (担当:分担執筆, 範囲:International Medical Science Course (2015年度国立台湾大学への10日間の派遣))
2016年

1. 膜交通関連オルガネラの減数分裂に伴う再構成須田, 恭之; 舘川, 宏之; 黒川, 量雄; 中野, 明彦; 入江賢児
第74回日本細胞生物学会大会 2022年6月28日
2. 胞子形成過程においてポリA鎖結合タンパク質Pab1はセプチンと共局在する田口将大; 入江賢児; 須田恭之
酵母遺伝学フォーラム 2021年8月31日
3. Vps13とSpo73-Spo71アダプター複合体の前胞子膜形成における役割藤枝祐二; 中村, 毅; 棟重賢治; 井上一朗; 中西秀樹; 須田恭之; 舘川宏之
酵母遺伝学フォーラム 2021年8月31日
4. 膜交通関連オルガネラの減数分裂・胞子形成における再構成須田, 恭之; 舘川宏之; 中野明彦; 入江賢児
酵母遺伝学フォーラム 2021年8月31日
5. 脂質輸送タンパク質 Vps13 の出芽酵母前胞子膜形成における役割藤枝祐二; 棟重賢治; 中村, 毅; 中西秀樹; 須田恭之; 舘川宏之
酵母遺伝学フォーラム 2020年9月7日
6. Visualization of the membrane traffic in budding yeast. 須田,恭之
Jiangnan university research seminar 2019年10月15日招待有り
7. 出芽酵母減数分裂における膜交通関連オルガネラの再構成須田, 恭之; 舘川, 宏之; 中野, 明彦; 入江, 賢児
酵母遺伝学フォーラム第52回研究報告会 2019年9月4日
8. Pop2の39番目のセリンのリン酸化はストレス応答遺伝子HSP12, HSP26のグルコース抑制制御に機能する Pham, Thi Kim Lien; Nguyen, Thi Minh Vie; 水野智亮; 須田, 恭之; 入江賢児
酵母遺伝学フォーラム第52回研究報告会 2019年9月4日
9. 出芽酵母減数分裂における膜交通関連オルガネラの再構成須田, 恭之; 舘川宏之; 中野明彦; 入江賢児
第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会合同年次大会 2019年6月24日
10. Live imaging of the Golgi apparatus in Saccharomyces cerevisiae Suda,Yasuyuki
Mini-symposium on membrane trafficking and remodeling 2018年5月5日 National Taiwan University College of Medicine 招待有り
11. ポリA分解酵素Ccr4はLRG1 mRNAのポリ(A)鎖長と翻訳を制御する。 Duong, Long Duy; Suda, Yasuyuki; 入江賢児
酵母遺伝学フォーラム第50回研究報告会 2017年9月11日
12. Cytoplasmic Deadenylases Ccr4 and Pop2 are Required for Translational Repression of LRG1 mRNA in the Stationary Phase. Valderrama, Arvin; Duy, Duong Long; Suda, Yasuyuki; Irie, Kenji
28th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology 2017年8月27日
13. Cytoplasmic Deadenylase Ccr4 is Required for Translational Repression of LRG1 mRNA in the Stationary Phase Suda,Yasuyuki
第 19 回日本 RNA 学会年会 2017年7月19日
14. 出芽酵母の前胞子膜伸長に必須な PP1 ターゲティングサブユニット Gip1 の解析 Suda,Yasuyuki
第69回日本細胞生物学会大会 2017年6月13日
15. 出芽酵母 Sec2 の胞子形成における役割 Suda,Yasuyuki
第69回日本細胞生物学会大会 2017年6月13日
16. Live Imaging of the Golgi apparatus in Saccharomyces cerevisiae Ishii, Midori; Suda, Yasuyuki; Kurokawa, Kazuo; Nakano, Akihiko
14th International Congress on Yeast 2016年9月11日
17. ポリA分解酵素Ccr4は定常状態でのLRG1 mRNAの翻訳抑制に関与する Suda,Yasuyuki
酵母遺伝学フォーラム第４９回研究報告会 2016年9月9日
18. ゴルジ体槽成熟における COPI の機能石井みどり; Suda, Yasuyuki; 黒川量雄; 中野明彦
第６８回日本細胞生物学会大会 2016年6月15日
19. Studies on the molecular mechanism of cisternal maturation in budding yeast Saccharomyces cerevisiae Ishii, Midori; Suda, Yasuyuki; Kurokawa, Kazuo; Nakano, Akihiko
Cell Biology of Yesat, Cold Spring Harbor Laboratory 2015年11月4日
20. Analysis of Scd6 physiological activity through its interaction with Hmt1 Lien, Thi Kim Pham; Kei, Muroi; Suda, Yasuyuki; Kenji, Irie
酵母遺伝学フォーラム第４８回研究報告会 2015年9月1日