ホーム > 浦 朋人/ URA, Tomoto

浦 朋人

URA, Tomoto

数理物質系 , 助教
Institute of Pure and Applied Sciences , Assistant Professor

  1. 1. Additive-Based Protein Stabilization for Stress-Prone and Unstable Proteins Tomoto Ura; Takumi Nakamura; Moe Iijima; Toya YoshidaKentaro Shiraki
      Protein Expression and Purification 106885 (2026) Semantic Scholar
  2. 2. A Nonequilibrium Simulation Framework for Reproducing Protein Aggregation in All-Atom Molecular Dynamics Simulations Moe Iijima; Toya Yoshida; Kentaro Shiraki; Tomoto Ura
      The Journal of Physical Chemistry B (2026)
  3. 3. Bench-top NMR of water signals: A non-destructive tool for biomacromolecule characterization Tomoto Ura; Taiji Oyama; Chiaki Nishimura
      Protein Expression and Purification (2026)
  4. 4. Arginine can either suppress or promote the aggregation of egg white proteins depending on solution conditions Takumi Nakamura; Akira Nomoto; Shunsuke Tomita; Tomoto UraKentaro Shiraki
      International Journal of Biological Macromolecules 150894 (2026)
  5. 5. Investigation of the functional hot-spot residues of an enzyme by real-time monitoring of the enzymatic reaction using NMR and computational approaches Toshihiko Sugiki; Tomoki Yoshida; Masaki Tsukamoto; Koichiro Miyanishi (+12 著者) Makoto Negoro
      Scientific Reports (2026)
  6. 6. Mechanistic insights into the salting-in effect of divalent cations on proteins: Interactions with carboxyl groups and peptide bonds Toya Yoshida; Tomoto Ura; Tsutomu Arakawa; Kentaro ShirakiAtsushi Hirano
      Journal of Molecular Liquids 129033 (2026) Semantic Scholar
  7. 7. Differences and Similarities in Protein and Nucleic Acid Structures and Their Biological Interactions Tsutomu Arakawa; Taiji Oyama; Tomoto Ura; Suguru Nishinami (+1 著者) Teruo Akuta
      Current Issues in Molecular Biology (2025)
  8. 8. Mechanism of 1,6-hexanediol-induced protein droplet dissolution: Thermodynamic insights from amino acid solubility Haruna Oda; Tomoto Ura; Hideaki Ono; Shinji Tanaka (+3 著者) Atsushi Hirano
      International Journal of Biological Macromolecules 149841 (2025)
  9. 9. Non-ionic Detergent-Assisted Refolding of Protein from Protein-SDS Complex Teruo Akuta; Tomoto Ura; Takeshi Oikawa; Takashi Shibata (+1 著者) Tsutomu Arakawa
      The Protein Journal (2025) Semantic Scholar
  10. 10. SDS protein interactions Tsutomu Arakawa; Daisuke Ejima; Tomoto Ura; Teruo AkutaMasamichi Oh-Ishi
      Biophysical Chemistry 107534 (2025)
  11. 11. Real-Time Metabolic Detection in Living Cells Using Hyperpolarized 13C NMR Tomoto Ura; Keita Saito; Ryoma Kobayashi; Natsuko MiuraYoichi Takakusagi
      Journal of Visualized Experiments 221: (2025)
  12. 12. Polymer-engineered condensates for enzyme activation Tomoto Ura; Toya Yoshida; Tsutomu Mikawa; Kentaro Shiraki
      Polymer Journal (2025) Semantic Scholar
  13. 13. Ferguson Plot Analysis of Chaperone ClpB from Moderate Halophile Teruo Akuta; Yui Tomioka; Tomoto Ura; Masataka NakagawaTsutomu Arakawa
      The Protein Journal (2025) Semantic Scholar
  14. 14. Effects of sodium dodecyl sulfate, Sarkosyl and sodium lauroyl glutamate on the structure of proteins monitored by agarose native gel electrophoresis and circular dichroism Teruo Akuta; Tomoto Ura; Takeshi Oikawa; Yui Tomioka (+1 著者) Tsutomu Arakawa
      Biophysical Chemistry 107316 (2024) Semantic Scholar
  15. 15. Cationic polyelectrolytes prevent the aggregation of l-lactate dehydrogenase under unstable conditions Toya Yoshida; Nanako Sakakibara; Tomoto Ura; Tsukuru MinamikiKentaro Shiraki
      International Journal of Biological Macromolecules 128549 (2023) Semantic Scholar
  16. 16. Activation of oxidoreductases by the formation of enzyme assembly Tomoto Ura; Nanako Sakakibara; Yu Hirano; Taro Tamada (+2 著者) Tsutomu Mikawa
      Scientific Reports 13: (2023) Semantic Scholar
  17. 17. Transient formation of multi-phase droplets caused by the addition of a folded protein into complex coacervates with an oppositely charged surface relative to the protein Nanako Sakakibara; Tomoto Ura; Tsutomu Mikawa; Hiroka SugaiKentaro Shiraki
      Soft Matter (2023) Semantic Scholar
  18. 18. Activation of L-lactate oxidase by the formation of enzyme assemblies through liquid–liquid phase separation Tomoto Ura; Ako Kagawa; Nanako Sakakibara; Hiromasa Yagi (+3 著者) Tsutomu Mikawa
      Scientific Reports 13: 1435 (2023) Semantic Scholar
  19. 19. Affinity of phenolic compounds for transition metal ions immobilized on cation-exchange columns Ura, T.; Kameda, T.; Laksmi, F.A.; Ishibashi, M. (+2 著者) Hirano, A.
      Journal of Chromatography A 1676: (2022) Semantic Scholar
  20. 20. Insight into the protein salting-in mechanism of arginine, magnesium chloride and ethylene glycol: Solvent interaction with aromatic solutes Ura, T.; Arakawa, T.; Shiraki, K.
      International Journal of Biological Macromolecules 188: (2021) Semantic Scholar
1 2
  1. 1. 相分離生物学の全貌 浦 朋人, 白木 賢太郎 (担当:分担執筆, 範囲:酵素反応と液-液相分離)
    白木 賢太郎編, 東京化学同人 2020年11月 (ISBN: 9784807913466)
  1. 1. 相分離液滴による酵素活性化とその応用可能性 浦 朋人
    第19回TRiSTAR共創リレーセミナー 2025年10月15日 招待有り
  2. 2. 酵素集合体の形成機構と機能、そして設計へ 浦朋人
    学術変革領域研究 (A) 予知生合成科学 2025年 若手合宿勉強会 2025年9月7日 招待有り
  3. 3. Development of Artificial Enzyme Condensates for Enhanced Enzyme Activation and Function in vitro
    Biomolecular condensates: From fundamental principles to applications in health and biotech 2025年5月13日
  4. 4. Relationship between intracellular dynamic enzyme assembly and their reaction efficiency using fluorescence microscopy and hyperpolarized 13C NMR
    Quantum Innovation 2024 2024年10月23日
  5. 5. Enzymes and liquid-liquid phase separation: In vitro and in cellulo
    IPR Seminar/The 8th LLPS Symposium/The Biophysical Society of Japan Joint Seminar “Toward establishing LLPS research systems” 2024年9月24日 招待有り
  6. 6. DNP-NMRによって細胞内で酵素活性を測る
    第2回DNP研究会 2024年3月21日 招待有り
  7. 7. 液 液相分離現象が酵素反応に与える効果 浦朋人
    JT医薬総合研究所講演会「相分離が支配する酵素反応系」 2022年4月25日 招待有り
  8. 8. 酵素連続反応と連動した液滴の動的挙動 浦 朋人; 冨田 峻介; 白木 賢太郎
    第44回日本分子生物学会年会 ワークショップ 液-液相分離の酵素連続反応に対する効果 2021年12月1日 招待有り
  9. 9. 酵素反応と連動した液滴の動的挙動 浦 朋人; 冨田 峻介; 白木 賢太郎
    第94回日本生化学大会 シンポジウム 相分離メガネを通して見た酵素の機能 2021年11月5日 招待有り
  10. 10. 液滴によるL-乳酸酸化酵素の活性化 浦 朋人; 香川 亜子; 八木 宏昌; 栃尾 尚哉; 木川 隆則; 美川 務; 白木 賢太郎
    第21回日本蛋白質科学会年会 ワークショップ タンパク質の液液相分離―計測、制御、応用 2021年6月17日 招待有り
  11. 11. 酵素連続反応と液–液相分離 浦 朋人; 白木 賢太郎
    第6回蛋白質工学研究会ワークショップ 蛋白質医薬における相分離現象の理解と産業利用可能性 2020年9月4日 招待有り
  12. 12. 液-液相分離による酵素反応の制御 浦 朋人
    大阪大学蛋白質研究所セミナー「液-液相分離の新たな展開へ向けて」/第3回LLPS研究会 2019年9月12日 招待有り
  13. 13. 酵素連続反応と液-液相分離 浦朋人
    第2回LLPS研究会 2019年4月3日 招待有り
  14. 14. 液-液相分離と酵素連続反応 浦朋人; 白木賢太郎
    第1回LLPS研究会 2018年8月31日 招待有り

 88 total views