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久米慶太郎

Kume, Keitaro

医学医療系 , 助教
Institute of Medicine , Assistant Professor

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1. An expanded phylogenomic analysis of Heterolobosea reveals the deep relationships, non-canonical genetic codes, and cryptic flagellate stages in the group. Pánek, Tomáš; Tice, Alexander K.; Corre, Pia; Hrubá, Pavla (+13 著者) Čepička, Ivan
Molecular Phylogenetics and Evolution 204: 108289 (2025)
2. Risk of postoperative pneumonia after extubation with the positive pressure versus normal pressure technique: a single-center retrospective observational study Shimada, Kensuke; Gosho, Masahiko; Ohigashi, Tomohiro; Kume, Keitaro (+8 著者) Tamiya, Nanako
Journal of anesthesia Epub: (2024) Semantic Scholar
3. Toward a Patient-Centered Care Supporting System: Integration of Multidisciplinary Health Records in Breast Cancer Care Sugiyama, Atsuko; Utsunomiya, Kazuki; Okumiya, Hayato; Fujimoto, Katsuhiko (+5 著者) Bando, Hiroko
Studies in health technology and informatics 316: 1719 (2024) Semantic Scholar
4. Machine-learning-based identification of patients with IgA nephropathy using a computerized medical billing database Tsunoda, Ryoya; Kume, Keitaro; Kagawa, Rina; Sanuki, Masaru (+2 著者) Yamagata, Kunihiro
PloS one 19: (2024) Semantic Scholar
5. Integrated Electronic Health Record of Multidisciplinary Professionals Throughout the Cancer Care Pathway: A Pilot Study Exploring Patient-Centered Information in Breast Cancer Patients Sugiyama, Atsuko; Okumiya, Hayato; Fujimoto, Katsuhiko; Utsunomiya, Kazuki (+5 著者) Bando, Hiroko
JOURNAL OF MULTIDISCIPLINARY HEALTHCARE 17: 2069 (2024) Semantic Scholar
6. Transcriptome data sets of free-living diplomonads, Treponema sp, and Hexamita sp. Kume, Keitaro; Tsubasa, Gen; Kazuki, Abe; Hiroshi, Komatsuzaki (+4 著者) Hashimoto, Tetsuo
MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS 12: e0050623 (2023) Semantic Scholar
7. AtLASS: A scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM. Harada, Ryo; Kume, Keitaro; Horie, Kazumasa; Nakayama, Takuro (+1 著者) Amagasa, Toshiyuki
IPSJ Transactions on Bioinformatics 16: 20 (2023) Semantic Scholar
8. Hospital-level Variation of the Cardiac Rehabilitation after Myocardial Infarction in Japan during Fiscal Years 2014?2015 using the National Database Sun, Yu; Jun, Komiyama; Takehiro, Sugiyama; Masao, Iwagami (+8 著者) Nanako, Tamiya
Circulation reports 5: 177 (2023) Semantic Scholar
9. Association between types of home healthcare and emergency house calls, hospitalization, and end-of-life care in Japan Sun, Yu; Iwagami, Masao; Komiyama, Jun; Sugiyama, Takehiro (+10 著者) Tamiya, Nanako
Journal of the American Geriatrics Society 71: 1795 (2023) Semantic Scholar
10. Draft genome sequence of Aduncisulcus paluster, a free-living microaerophilic eukaryote belonging to Fornicata. Ikuko, Yuyama; Kume, Keitaro; Tamura, Takumi; Inagaki, YujiHashimoto, Tetsuo
Microbiology Resource Announcements 12: e0053922 (2023) Semantic Scholar
11. The Effect of Home Care Support Clinics on Hospital Readmission in Heart Failure Patients in Japan Sun, Yu; Iwagami, Masao; Komiyama, Jun; Sugiyama, Takehiro (+10 著者) Tamiya, Nanako
Journal of general internal medicine 38: 2156 (2023) Semantic Scholar
12. Genome evolution of a nonparasitic secondary heterotroph, the diatom Kamikawa, Ryoma; Mochizuki, Takako; Sakamoto, Mika; Tanizawa, Yasuhiro (+24 著者) Nakamura, Yasukazu
Science advances 8: eabi5075 (2022) Semantic Scholar
13. Medical expenditures for fragility hip fracture in Japan: a study using the nationwide health insurance claims database Mori, Takahiro; Komiyama, Jun; Fujii, Tomoko; Sanuki, Masaru (+6 著者) Sugiyama, Takehiro
Archives of osteoporosis 17: 61 (2022) Semantic Scholar
14. Progress in understanding the phylogeny of the Plasmodium vivax lineage Arisue, Nobuko; Honma, Hajime; Kume, Keitaro; Hashimoto, Tetsuo
PARASITOLOGY INTERNATIONAL 87: 102507 (2022) Semantic Scholar
15. The closest relative of Archaeplastida is revealed by phylogenomic analyses that include Microheliella maris. Yazaki, Euki; Yabuki, Akinori; Imaizumi, Ayaka; Kume, Keitaro (+1 著者) Inagaki, Yuji
Open Biology 12: 210376 (2022) Semantic Scholar
16. Phylogenomics invokes the clade housing Cryptista, Archaeplastida, and Microheliella maris. Yazaki, Euki; Yabuki, Akinori; Imaizumi, Ayaka; Kume, Keitaro (+1 著者) Inagaki, Yuji
bioRχiv (2021) Semantic Scholar
17. Barthelonids represent a deep-branching metamonad clade with mitochondrion-related organelles predicted to generate no ATP Euki, Yazaki; Kume, Keitaro; Takashi, Shiratori; Yana, Eglit (+5 著者) Inagaki, Yuji
Proceedings of the Royal Society B 287: 20201538 (2020) Semantic Scholar
18. Mitochondrial genomes of Hemiarma marina and Leucocryptos marina revised the evolution of cytochrome c maturation in Cryptista. Yuki, Nishimura; Keitaro, Kume; Keito, Sonehara; Goro, Tanifuji (+4 著者) Moriya, Ohkuma
Frontiers in Ecology and Evolution 8: 140 (2020) Semantic Scholar
19. Barthelonids represent a deep-branching Matamonada clade with mitochondrion-related organelles generating no ATP. Euki, Yazaki; Kume, Keitaro; Takashi, Shiratori; Yana, Edli (+5 著者) Inagaki, Yuji
bioRχiv (2019)
20. Apicoplast phylogeny reveals the position of Plasmodium vivax basal to the Asian primate malaria parasite clade Arisue, Nobuko; Hashimoto, Tetsuo; Kawai, Satoru; Honma, Hajime (+1 著者) Horii, Toshihiro
Scientific Reports 9: 7274 (2019) Semantic Scholar

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1. 全国レセプトデータを用いた在宅療養支援診療所の心不全再入院に対する予防孫瑜; 岩上将夫; 小宮山潤; 杉山, 雄大; 井口竜太; 佐方信夫; 伊藤智子; 吉江悟; 讃岐勝; 久米慶太郎; 松居宏樹; 植嶋大晃; 加藤源太; 森由希子; 田宮菜奈子
第81回日本公衆衛生学会 2022年10月7日
2. Microheriella maris units Archaeplastida and Cryptista in phylogenomics. Euki, Yazaki; Akinori, Yabuki; Ayaka, Imaizumi; Keitaro, Kume; Tetsuo, Hashimoto; Inagaki, Yuji
Asian Congress of Protistology IV 2021年11月19日
3. エンドヘレア太陽虫Microheliella marisの系統的位置とミトコンドリアゲノム．矢吹彬憲; 矢﨑裕規; 今泉彩香; 白鳥峻志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 稲垣, 祐司
日本藻類学会第44回大会 2020年3月26日
4. エンドヘレア太陽虫Microheliella marisの系統的位置とミトコンドリアゲノム．矢吹彬憲; 矢﨑裕規; 今泉彩香; 白鳥峻志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 稲垣, 祐司
日本藻類学会第44回大会 2020年3月19日
5. フィロジェノミック解析により推測されたMicroheliella marisの系統的位置．矢﨑裕規; 今泉彩香; 久米慶太郎; 白鳥峻志; 橋本哲男; 矢吹彬憲; 石田健一郎; 稲垣, 祐司
第3回日本共生学会大会 2019年11月19日
6. 有孔虫Ammonia beccariiのミトコンドリアに局在するDNA分子群．石谷佳之; 久米慶太郎; 稲垣, 祐司
第3回日本共生生物学会 2019年11月19日
7. Mitochondrial genome of strain SRT308: insights into structure and gene content fo the ancestral euglenozoan mitochondrial genome. Yazaki, Euki; Shiratori, Takashi; Kume, Keitaro; Hashimoto, Tetsuo; Ishida, Ken-ichiro; Inagaki, Yuji
ISEP XXII 2018年5月27日
8. ユーグレノゾア基部から分岐する新奇原生生物のミトコンドリアゲノム. 矢崎裕規; 白鳥峻志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 石田健一郎; Inagaki, Yuji
第50回日本原生生物学会・第1回日本共生生物学会合同大会 2017年11月17日
9. A heterolobosean strain SRT213 and its mitochondrion-related organelle. Yazaki, Euki; Shiratori, Takashi; Kume, Keitaro; Hashimoto, Tetsuo; Ishida, Ken-ichiro; Inagaki, Yuji
ICOP2017 2017年7月31日
10. The draft genome of Kipferlia bialata reveals that the gain of function contributes the massive reductive evolution in Metamonada. Goro, Tanifuji; Sun, Takabayashi; Keitaro, Kume; Mizue, Takagi; Inagaki, Yuji; Tetsuo, Hashimoto
Protis-2016 Moscow Forum 2016年6月6日
11. 機械学習を用いた非モデル生物におけるミトコンドリア及び関連オルガネラタンパク質の予測手法久米慶太郎; 天笠俊之; 橋本, 哲男; 北川, 博之
情報処理学会研究報告バイオ情報学研究会 2016年6月情報処理学会
12. フォルニカータ生物群の基部から分岐する新奇嫌気性生物PAP020株のミトコンドリア様オルガネラの代謝機能の推測矢崎裕規; 白鳥峻志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 石田健一郎; 稲垣, 祐司
第85回日本寄生虫学会 2016年3月19日
13. Prediction and comparison of the metabolism of mitochondrion-related organelles in free-living fornicate organisms. Keitaro, Kume; Shun, Takabayashi; Ryoma, Kamikawa; Goro, Tanifuji; Inagaki, Yuji; Tetsuo, Hashimoto
2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells 2015年9月30日
14. Strain PAP020, a novel anaerobic microeukaryote branching at the base of Fornicata. Euki, Yazaki; Takashi, Shiratori; Keitaro, Kume; Sohta, A Ishikawa; Ken-ichiro, Ishida; Tetsuo, Hashimoto; Inagaki, Yuji
VII ECOP-ISOP Joint Meeting 2015 2015年9月5日
15. トランスクリプトームデータを基盤とした大規模分子系統解析による新奇嫌気性真核微生物PAP020株の系統的位置の解明矢崎裕規; 白鳥隆志; 久米慶太郎; 橋本哲男; 石田健一郎; 稲垣, 祐司
日本進化学会第17回大会 2015年8月20日
16. Is a microaerophilic flagellate strain PAP020 is the most basal member of the Fornicata? Euki, Yazaki; Takashi, Shiratori; Keitaro, Kume; Sohta, A Ishikawa; Ken-ichiro, Ishida; Tetsuo, Hashimoto; Inagaki, Yuji
Annual Meeting of Canadian Institute for Advanced Research, Integrated Microbial Biodiversity Program 2015年5月27日
17. フォルニカータ生物Kipferlia bialataの二者培養系の確立とゲノム・トランスクリプトーム解析高林舜; 谷藤吾朗; 久米慶太郎; 稲垣, 祐司; 橋本哲男
第84回日本寄生虫学会大会 2015年3月21日
18. キネトプラスチダ類における寄生性鞭毛虫の系統的位置と寄生性形質獲得プロセスの解明矢﨑裕規; 石川奏太; 久米慶太郎; 谷藤吾朗; 橋本哲男; 稲垣, 祐司
日本進化学会第16回大会 2014年8月21日
19. フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラ標的シグナルの分子進化久米慶太郎; 高林舜; 森田幸之介; 神川龍馬; 稲垣, 祐司; 橋本哲男
第83回日本寄生虫学会 2014年3月27日
20. Fornicata生物のミトコンドリア関連オルガネラタンパク質におけるmatrix targeting signal 久米慶太郎; 高林舜; 森田幸之介; 神川龍馬; 稲垣, 祐司; 橋本哲男
第15回日本進化学会 2013年8月28日