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土肥裕希

ALUMNI 2025年12月現在、筑波大学が主たる所属機関ではありません

Doi, Yuki

筑波大学 , 客員研究員
University of Tsukuba

オープンアクセス版の論文は「つくばリポジトリ」で読むことができます。

1. Unique electron transfer system of cytochrome P450 monooxygenase includes a mechanism of fatty acid β-oxidation. Saito Kojima; Kyosei Shinji; Hana Namiki; Kouta Suzuki (+7 著者) Naoki Takaya
Communications biology 8: 1361 (2025)
2. Mechanism of soil bacteria (Cupriavidus sp. LA-1) for degrading natural pterin and lumazine pigments. Yuki Doi; Norifumi Maeda; Naoki Takaya
Communications biology 8: 1292 (2025)
3. Complete genome sequence of Shinella sp. strain 1A1, an ʟ-glucose-utilizing bacterium isolated from soil. Yuki Doi; Akito Hama; Akira Nakamura
Microbiology resource announcements 14: e0021725 (2025)
4. Tumour-resident oncolytic bacteria trigger potent anticancer effects through selective intratumoural thrombosis and necrosis. Seigo Iwata; Taisei Nishiyama; Matomo Sakari; Yuki Doi (+4 著者) Eijiro Miyako
Nature biomedical engineering (2025)
5. Photocatalytic scaffolds enhance anticancer performances of bacterial consortium AUN Mikako Miyahara; Yuki Doi; Naoki Takaya; Eijiro Miyako
CHEMICAL ENGINEERING JOURNAL 499: (2024)
6. Temporal and fertilizer-dependent dynamics of soil bacterial communities in buckwheat fields under long-term management. Susumu Morigasaki; Motomu Matsui; Iwao Ohtsu; Yuki Doi (+4 著者) Naoki Takaya
Scientific reports 14: 9896 (2024)
7. The Metabolic Regulation of Amino Acid Synthesis Counteracts Reactive Nitrogen Stress via Aspergillus nidulans Cross-Pathway Control. Madoka Amahisa; Madoka Tsukagoshi; Chihiro Kadooka; Shunsuke Masuo (+3 著者) Naoki Takaya
Journal of fungi (Basel, Switzerland) 10: (2024)
8. Fungal glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase GpdC maintains glycolytic mechanism against reactive nitrogen stress-induced damage. Chihiro Kadooka; Nozomi Katsuki; Shunsuke Masuo; Saito Kojima (+4 著者) Naoki Takaya
Frontiers in microbiology 15: 1475567 (2024)
9. Protocatechuate hydroxylase is a novel group A flavoprotein monooxygenase with a unique substrate recognition mechanism. Nozomi Katsuki; Riku Fukushima; Yuki Doi; Shunsuke Masuo (+3 著者) Naoki Takaya
The Journal of biological chemistry 300: 105508 (2024)
10. Carboxypeptidase G and pterin deaminase metabolic pathways degrade folic acid in Variovorax sp. F1. Yungmi You; Yuki Doi; Norifumi Maeda; Shunsuke Masuo (+1 著者) Naoki Takaya
BMC microbiology 22: 225 (2022)
11. Symbiotic riboflavin degradation by Microbacterium and Nocardioides bacteria. Hiroshi Kanazawa; Sayoko Ozaki; Yuki Doi; Shunsuke MasuoNaoki Takaya
Bioscience, biotechnology, and biochemistry 84: 1056 (2020)
12. Correction to: Glycerol metabolism and its regulation in lactic acid bacteria. Yuki Doi
Applied microbiology and biotechnology 103: 5459 (2019)
13. Glycerol metabolism and its regulation in lactic acid bacteria. Yuki Doi
Applied microbiology and biotechnology 103: 5079 (2019)
14. Lactic acid fermentation is the main aerobic metabolic pathway in Enterococcus faecalis metabolizing a high concentration of glycerol. Yuki Doi
Applied microbiology and biotechnology 102: 10183 (2018)
15. Complete Genome Sequence of Enterococcus faecalis Strain W11 Isolated from an Algal Food Product. Yuki Doi; Noboru Takizawa
Genome announcements 4: (2016)
16. Hydrazidase, a novel amidase signature enzyme that hydrolyzes acylhydrazides. Ken-Ichi Oinuma; Atsushi Takuwa; Kosuke Taniyama; Yuki DoiNaoki Takaya
Journal of bacteriology 197: 1115 (2015)
17. L-lactate production from biodiesel-derived crude glycerol by metabolically engineered Enterococcus faecalis: cytotoxic evaluation of biodiesel waste and development of a glycerol-inducible gene expression system. Yuki Doi
Applied and environmental microbiology 81: 2082 (2015)
18. A novel A3 group aconitase tolerates oxidation and nitric oxide. Yuki Doi; Naoki Takaya
The Journal of biological chemistry 290: 1412 (2015)
19. Pyruvate formate-lyase is essential for fumarate-independent anaerobic glycerol utilization in the Enterococcus faecalis strain W11. Yuki Doi; Yuki Ikegami
Journal of bacteriology 196: 2472 (2014)
20. Achromobacter denitrificans strain YD35 pyruvate dehydrogenase controls NADH production to allow tolerance to extremely high nitrite levels. Yuki Doi; Motoyuki Shimizu; Tomoya Fujita; Akira Nakamura (+1 著者) Naoki Takaya
Applied and environmental microbiology 80: 1910 (2014)

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書籍等出版物情報はまだありません。

1. 細菌ʟ-glucose 代謝の初発酵素ʟ-glucose dehydrogenaseに関する解析岩渕真也; 土肥裕希; 中村顕
日本農芸化学会関東支部 2025年度大会 2025年8月30日
2. 細菌ドメインにおけるʟ-glucose dehydrogenaseの解析岩渕真也; 土肥裕希; 中村顕
日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月5日
3. 環境土壌におけるキサントプテリン分解菌の群集構造と分解機構山田龍幸; 土肥裕希; 高谷直樹
日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月5日
4. 環境細菌に見出されたプテリジン化合物の多様な分解代謝土肥裕希; 塩田大地; 山田龍幸; 岩尾隼平; 高谷直樹
日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月5日
5. 環境細菌に潜在する新規代謝機構の発見と解明土肥裕希
日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月4日
6. 環境土壌におけるキサントプテリン分解菌の群集構造と分解機構山田龍幸; 土肥裕希; 高谷直樹
日本微生物生態学会第37回大会 2024年10月30日
7. 環境中から単離されたRhodococcus sp. LC-2 株のルミクロム分解経路の同定塩田大地; 土肥裕希; 高谷直樹
日本微生物生態学会第37回大会 2024年10月30日
8. 細菌ドメインにおけるʟ-glucose脱水素酵素の解析岩渕真也; 土肥裕希; 中村顕
日本農芸化学会関東支部 2024年度大会 2024年8月30日
9. Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明塩田大地; 土肥裕希; 高谷直樹
日本農芸化学会関東支部 2024年度大会 2024年8月30日
10. Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明塩田大地; 土肥裕希; 高谷直樹
日本農芸化学会 2024年度大会 2024年3月27日
11. Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明塩田大地; 土肥裕希; 高谷直樹
日本微生物生態学会第36回大会 2023年11月28日
12. Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解を担う新規Cytochrome P450水酸化酵素の解析土肥裕希; 塩田大地; 高谷直樹
日本農芸化学会関東支部 2023年度大会 2023年8月25日
13. Rhodococcus sp. LC-2株のルミクロム分解機構の解明塩田大地; 土肥裕希; 高谷直樹
環境バイオテクノロジー学会 2023年度大会 2023年6月8日
14. ʟ-glucose資化菌の微生物生態学的解析と代謝機構の解析濱彰人; 土肥裕希; 中村顕
日本農芸化学会 2023年度大会 2023年3月15日
15. Cupriavidus sp. LA-1株のプテリジン化合物分解機構の解明土肥裕希; 前田典歩; 高谷直樹
日本農芸化学会 2023年度大会 2023年3月15日
16. 環境土壌における葉酸資化性菌の群集構造解析戸田征宏; 前田典歩; 土肥裕希; 高谷直樹
日本農芸化学会 2023年度大会 2023年3月14日
17. 細菌によるプテリジン分解機構の解明前田典歩; 土肥裕希; 高谷直樹
環境バイオテクノロジー学会 2022年度大会 2022年11月21日
18. 土壌微生物によるプテリジン色素分解機構の解明前田典歩; 土肥裕希; 高谷直樹
日本微生物生態学会第35回大会 2022年10月31日
19. Cupriavidus sp. LA-1株によるルマジン分解機構の解明前田典歩; 土肥裕希; 高谷直樹
日本農芸化学会関東支部 2022年度大会 2022年8月27日
20. Lumazine utilization pathway in Cupriavidus sp. strain LA-1 Maeda Norifumi; Doi Yuki; Takaya Naoki
International Union of Microbiological Societies 2022 2022年7月20日