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西澤 宏晃

ALUMNI 2025年6月現在、筑波大学が主たる所属機関ではありません

Nishizawa, Hiroaki

国立研究開発法人物質・材料研究機構 , 総合型材料開発・情報基盤部門 エネルギー材料設計グループ , NIMS ポスドク研究員
National Institute for Materials Science , Research and Service Division of Materials Data and Integrated SystemEnergy Material Design Group , NIMS Postdoctoral Researcher

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  1. 1. Parallel cascade selection molecular dynamics to screen for protein complexes generated by rigid docking Ryuhei Harada; Ryunosuke Yoshino; Hiroaki Nishizawa; Yasuteru Shigeta
      Journal of Molecular Graphics and Modelling 92: 94 (2019) Semantic Scholar
  2. 2. Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Simulation (PaCS-MD) Screens for Protein Complexes Generated by Rigid Docking Harada Ryuhei; Yoshino Ryunosuke; Nishizawa Hiroaki; Shigeta Yasuteru
      JOURNAL OF MOLECULAR GRAPHICS AND MODELING 92: 94 (2019)
  3. 3. Temperature–pressure shuffling outlier flooding method enhances the conformational sampling of proteins Ryuhei Harada; Ryunosuke Yoshino; Hiroaki Nishizawa; Yasuteru Shigeta
      Journal of Computational Chemistory 40: 1530 (2019) Semantic Scholar
  4. 4. Quantum chemical approach for positron annihilation spectra of atoms and molecules beyond plane-wave approximation Yasuhiro Ikabata; Risa Aiba; Toru Iwanade; Hiroaki Nishizawa (+1 著者) Hiromi Nakai
      Journal of Chemical Physics 148: 184110 (9 pages) (2018) Semantic Scholar
  5. 5. Classical Molecular Dynamics Simulation to Understand Role of a Zinc Ion for Aggregation of Amyloid-β Peptides Hiroaki Nishizawa; Hisashi Okumura
      Journal of Computer Chemistry, Japan 17: 76 (2018) Semantic Scholar
  6. 6. Rapid QM/MM Approach for Biomolecular Systems under Periodic Boundary Conditions: Combination of the Density-Functional Tight-Binding Theory and Particle Mesh Ewald Method Hiroaki Nishizawa; Hisashi Okumura
      JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 37: 2701 (2016) Semantic Scholar
  7. 7. Quantum Chemistry beyond Born-Oppenheimer Approximation on a Quantum Computer: A Simulated Phase Estimation Study Libor Veis; Jakub Visnak; Hiroaki Nishizawa; Hiromi NakaiJiri Pittner
      INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY 116: 1328 (2016) Semantic Scholar
  8. 8. Three pillars for achieving quantum mechanical molecular dynamics simulations of huge systems: Divide-and-conquer, density-functional tight-binding, and massively parallel computation Hiroaki Nishizawa; Yoshifumi Nishimura; Masato Kobayashi; Stephan IrleHiromi Nakai
      JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 37: 1983 (2016) Semantic Scholar
  9. 9. Comparison of Replica-Permutation Molecular Dynamics Simulations with and without Detailed Balance Condition Hiroaki Nishizawa; Hisashi Okumura
      JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN 84: 074801 (6 Pages) (2015) Semantic Scholar
  10. 10. 2P006 レプリカ置換分子動力学法の詳細釣り合い条件の有無に対する検証と生体分子への応用(01A. 蛋白質:構造,ポスター,第52回日本生物物理学会年会(2014年度)) Nishizawa Hiroaki; Okumura Hisashi
      Seibutsu Butsuri 54: S195 (2014) Semantic Scholar
  11. 11. 原子核の量子効果を考慮した高精度な分子理論の開発 西澤宏晃
      Waseda University (2012)
  12. 12. Development of the explicitly correlated Gaussian-nuclear orbital plus molecular orbital theory: Incorporation of electron-electron correlation Hiroaki Nishizawa; Yutaka Imamura; Yasuhiro Ikabata; Hiromi Nakai
      CHEMICAL PHYSICS LETTERS 533: 100 (2012) Semantic Scholar
  13. 13. Evaluation of electron repulsion integral of the explicitly correlated Gaussian-nuclear orbital plus molecular orbital theory Hiroaki Nishizawa; Minoru Hoshino; Yutaka Imamura; Hiromi Nakai
      CHEMICAL PHYSICS LETTERS 521: 142 (2012) Semantic Scholar
  14. 14. Rigorous non-Born-Oppenheimer theory: Combination of explicitly correlated Gaussian method and nuclear orbital plus molecular orbital theory Minoru Hoshino; Hiroaki Nishizawa; Hiromi Nakai
      JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 135: 024111 (13 pages) (2011) Semantic Scholar
  15. 15. Hybrid treatment combining the translation- and rotation-free nuclear orbital plus molecular orbital theory with generator coordinate method: TRF-NOMO/GCM Keitaro Sodeyama; Hiroaki Nishizawa; Minoru Hoshino; Masato KobayashiHiromi Nakai
      CHEMICAL PHYSICS LETTERS 433: 409 (2007) Semantic Scholar

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  1. 1. Development of the rapid QM/MM molecular dynamics techniques aimed at medium molecular drug discovery 西澤宏晃
    AHeDD2019/IPAB2019 Joint Symposium 2019年11月28日
  2. 2. DFTB-MDシミュレーションの拘束条件を用いた効率化とエネルギー保存の検証 西澤宏晃; 重田育照
    日本コンピューター化学会2019秋季年会 2019年10月24日
  3. 3. 拘束条件を用いたDFTB-MDシミュレーションの高速化とエネルギー保存の評価 西澤宏晃; 重田育照
    第57回日本生物物理学会年会 2019年9月24日
  4. 4. 分子動力学シミュレーションによるアミロイドβペプチド全長の凝集 奥村久士; 西澤宏晃; 伊藤暁
    第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会 合同年次大会 2019年6月24日
  5. 5. 量子化学計算に基づく分子動力学シミュレーションの拘束手法とエネルギー保存の検証 西澤宏晃; 重田育照
    第46回生体分子科学討論会 2019年6月21日
  6. 6. 拘束条件付きDFTB-MD計算に対するエネルギー保存の検証 西澤宏晃; 重田育照
    第22回理論化学討論会 2019年5月22日
  7. 7. アミロイドβ凝集の初期過程に対するQM/MM法を用いた解析 西澤宏晃; 奥村久志
    第56回日本生物物理学会年会 2018年9月15日
  8. 8. 大規模分子の凝集シミュレーション計算手法 西澤宏晃
    第58回分子科学若手の会 夏の学校 2018年8月20日
  9. 9. アミロイドβ凝集における亜鉛イオンの役割の計算解析 西澤宏晃; 奥村久志
    スーパーコンピュータワークショップ2017 2018年1月24日
  10. 10. Theoretical Assessment of the Role of a Zinc Ion in Amyloid-β Aggregation 西澤宏晃; 奥村久志
    新学術領域研究「動的秩序と機能」 第6回国際シンポジウム 2018年1月20日
  11. 11. QM/MM分子動力学法を用いた金属イオン存在下でのアミロイドβ凝集に対する理論的研究 西澤宏晃; 奥村久志
    第31回分子シュミレーション討論会 2017年11月29日
  12. 12. アミロイドβ凝集の初期過程に対するQM/MM法を用いた解析 西澤宏晃; 奥村久志
    第55回日本生物物理学会年会 2017年9月19日
  13. 13. 密度汎関数強束縛法を用いた金属イオンによる生体分子凝集に対する理論的研究 西澤宏晃; 奥村久志
    第11回分子科学討論会2017 2017年9月15日
  14. 14. Acceleration of QM/MM molecular dynamics for metal-containing large biomolecules Hiroaki Nishizawa; Hisashi Okumura
    19th IUPAB congress and 11th EBSA congress 2017年7月16日
  15. 15. 生体分子動力学のための高速なQM/MM理論の開発 西澤宏晃; 奥村久志
    第44回生体分子科学討論会 2017年6月23日
  16. 16. 密度汎関数強束縛法に基づく 大規模分子動力学計算手法の開発 西澤宏晃
    研究会 凝縮系の理論化学2017 2017年4月8日

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