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重田 育照

Shigeta, Yasuteru

計算科学研究センター , 教授
Center for Computational Sciences , Professor

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  1. 1. Enantioselective interactions of aminonitrile dimers Natsuki Watanabe; Yu Komatsu; Koichi Miyagawa; Yuta Hori (+1 著者) Mitsuo Shoji
      Physical Chemistry Chemical Physics (2025) Semantic Scholar
  2. 2. Rationally designed antimicrobial peptides with high selectivity and efficiency against phytopathogenic Ralstonia solanecearum Melvalia Cristin Manik; Nitchakan Darai; Thanyada Rungrotmongkol; Lian Duan (+3 著者) Alisa S. Vangnai
      Science of The Total Environment 976: 179354 (2025)
  3. 3. Identification of novel TMEM16A blockers through integrated virtual screening, molecular dynamics, and experimental studies Sangkhawasi, Mattanun; Pitaktrakul, Wichuda; Khumjiang, Rungtiwa; Shigeta, Yasuteru (+3 著者) Thanyada
      Scientific reports 15: (2025)
  4. 4. Structure and catalytic activity of a dihydrofolate reductase-like enzyme from Leptospira interrogans Chandit, Charin; Hengphasatporn, Kowi; Donsuy, Pattraporn; Shigeta, YasuteruWangkanont, Kittikhun
      INTERNATIONAL JOURNAL OF BIOLOGICAL MACROMOLECULES 298: (2025)
  5. 5. Exploring mimosamycin as a Janus kinase 2 inhibitor: A combined computational and experimental investigation Sanachai, Kamonpan; Hengphasatporn, Kowi; Chamni, Supakarn; Suwanborirux, Khani (+5 著者) Thanyada
      COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 115: (2025)
  6. 6. Regulatory mimicry of cyclin-dependent kinases by a conserved herpesvirus protein kinase Koyanagi, Naoto; Hengphasatporn, Kowi; Kato, Akihisa; Nobe, Moeka (+4 著者) Kawaguchi, Yasushi
      Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 122: (2025)
  7. 7. Pseudo[3]rotaxane and [3]Rotaxane of Per(5-carboxy-5-dehydroxymethyl)-Cyclodextrins Utilizing Carboxylic Acid Dimer as Recognition Units Nakamura, Takashi; Kuwabara, Masamune; Zhang, Haoyang; Okazawa, Kazuki (+2 著者) Nabeshima, Tatsuya
      The Journal of Organic Chemistry 90: 3603 (2025)
  8. 8. Reaction Mechanism Path Sampling Based on Parallel Cascade Selection QM/MM Molecular Dynamics Simulation: PaCS-Q Duan, Lian; HENGPHASATPORN, Kowi; Harada, Ryuhei; Shigeta, Yasuteru
      JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION (2025)
  9. 9. Apoprotein Intermolecular Interactions and Heme Insertion for 3D Domain Swapping in Myoglobin Gissi Novientri; Koji Takeda; Lian Duan; Kowit Hengphasatporn (+3 著者) Shun Hirota
      ACS Omega (2025)
  10. 10. Characterization of Delta-7 Alkenone Desaturase in Haptophyte Gephyrocapsa huxleyi Through Heterologous Expression in Tisochrysis lutea Yoneda, Kohei; Kobayashi, Chinatsu; Araie, Hiroya; Morita, Rikuri (+4 著者) Suzuki, Iwane
      MARINE BIOTECHNOLOGY 27: (2025)
  11. 11. Rational Design and Engineering of Conducting Polymers for Chemical Enhancement in Raman Scattering Huanhuan Zhang; Jun Yu Dong; Xuke Tang; Naoki Kishimoto (+16 著者) Keisuke Goda
      Advanced Optical Materials (2025)
  12. 12. Polysulfur-based bulking of dynamin-related protein 1 prevents ischemic sulfide catabolism and heart failure in mice Nishimura, Akiyuki; Ogata, Seiryo; Tang, Xiaokang; Hengphasatporn, Kowi (+11 著者) Nishida, Motohiro
      NATURE COMMUNICATIONS 16: 276 (2025)
  13. 13. Theoretical investigation of sustainable CO2 electroreduction to high-value products utilizing N-doped/BN-modified Triphenylene-Graphdiyne catalysts Sirilak Kongkaew; Manussada Ratanasak; Yasuteru Shigeta; Jun-ya HasegawaVudhichai Parasuk
      Fuel (2025) Semantic Scholar
  14. 14. Experimental and Computational Studies on Domain-Swapped Structure Stabilization of an Antibody Light Chain by Disulfide Bond Introduction. Wahyu Fitriana; Takahiro Sakai; Lian Duan; Kowit Hengphasatporn (+4 著者) Shun Hirota
      Journal of medicinal chemistry 67: 22313 (2024)
  15. 15. Structural Fluctuation in Homodimeric Aminoacyl-tRNA Synthetases Induces Half-of-the-Sites Activity Yoshino Okamoto; Takunori Yasuda; Rikuri Morita; Yasuteru ShigetaRyuhei Harada
      The Journal of Physical Chemistry B (2024) Semantic Scholar
  16. 16. GPNMB is a novel binding partner of FGFR1 that affects tumorigenic potential through AKT phosphorylation in TNBC Elhinnawi; Manar A.; Okita, Yukari; Shigematsu, Katsunobu (+6 著者) Kato, Mitsuyasu
      CANCER SCIENCE 116: 432 (2024) Semantic Scholar
  17. 17. Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Darunavir Analogs as HIV-1 Protease Inhibitors Muhammad Asad Ur Rehman; Hathaichanok Chuntakaruk; Soraat Amphan; Aphinya Suroengrit (+6 著者) Tanatorn Khotavivattana
      ACS Bio & Med Chem Au (2024)
  18. 18. BEMM-GEN: A Toolkit for Generating a Biomolecular Environment-Mimicking Model for Molecular Dynamics Simulation Takunori Yasuda; Rikuri Morita; Yasuteru Shigeta; Ryuhei Harada
      Journal of Chemical Information and Modeling (2024) Semantic Scholar
  19. 19. Evaluating solubility, stability, and inclusion complexation of oxyresveratrol with various β-cyclodextrin derivatives using advanced computational techniques and experimental validation Ali, Saba; Aman, Aamir; Hengphasatporn, Kowi; Oopkaew, Lipika (+10 著者) Thanyada
      COMPUTATIONAL BIOLOGY AND CHEMISTRY 112: (2024) Semantic Scholar
  20. 20. Why is Dimeric 3D Domain Swapping in Antibody Light Chains Missing from the Solution? Atomistic Insights Mechanisms Lian Duan; Kowit Hengphasatporn; Takahiro Sakai; Ryo Fujiki (+2 著者) Yasuteru Shigeta
      The Journal of Physical Chemistry B (2024) Semantic Scholar
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  1. 1. Hydrogenomics: The Science of Fully Utilizing Hydrogen Hori, Yuta; Nishikawa, Koji; Shigeta, Yasuteru; Higuchi, Yoshiki
    共立出版 2023年4月
  2. 2. Recent advances of the fragment molecular orbital method Subtitle: Enhanced performance and applicability Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:AnalysisFMO toolkit: PyMOL plugin module to 3D-visualize interaction energies in protein (3D-VIEP) generated by fragment molecular orbital calculation)
    Springer 2021年1月 (ISBN: 9789811592355)
  3. 3. Recent advances of the fragment molecular orbital method Subtitle: Enhanced performance and applicability Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:AnalysisFMO toolkit: PyMOL plugin module to 3D-visualize interaction energies in protein (3D-VIEP) generated by fragment molecular orbital calculation)
    Springer 2021年1月 (ISBN: 9789811592355)
  4. 4. Advances in Quantum Chemistry Shigeta, Yasuteru; Harada, Ryuhei (担当:分担執筆, 範囲:Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Simulations for Transition Pathway Sampling of Biomolecules)
    2019年1月
  5. 5. Quantum Systems in Physics, Chemistry, and Biology: Advances in Concepts and Applications Baba, Takeshi; Kamiya, Katsumasa; Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Integrated Computational Studies on Mutational Effects of A Nylon-degrading Enzyme)
    2017年6月 (ISBN: 9783319502540)
  6. 6. Reference modules in Materials Science and Engineering 2016 Harada, Ryuhei; Inagaki, Yuji; Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Protein Folding and Evolution)
    2016年6月
  7. 7. 金属錯体の量子・計算化学 重田,育照; 北河康隆 (担当:分担執筆, 範囲:第4-1章 錯体の伝導性)
    2014年10月
  8. 8. Quantum mechanics Chap. 17 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Quantal Cumulant Mechanics as Extended Ehrenfest Theorem)
    InTech open 2013年4月
  9. 9. Conceptual and Computational Advances in Quantum Chemistry, Chap. 25 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Theoretical Studies on Metal-Containing Artificial DNA Bases”, Advances in the Theory of Atomic and Molecular Systems)
    Springer 2012年10月
  10. 10. Advances in the Theory of Atomic and Molecular Systems, Conceptual and Computational Advances in Quantum Chemistry, Chap. 21 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Quantum Theory in Terms of Cumulant Variables)
    Springer 2009年10月
  11. 11. ADVANCES IN THE THEORY OF ATOMIC AND MOLECULAR SYSTEMS: DYNAMICS, SPECTROSCOPY, CLUSTERS, AND NANOSTRUCTURES Shigeta, Yasuteru; Miyachi, Hideaki; Matsui, Toru; Yokoyama, Norisuke; Hirao, Kimihiko (担当:分担執筆, 範囲:Quantum Theory in Terms of Cumulant Variables)
    SPRINGER 2009年1月 (ISBN: 9789048129843)
  12. 12. Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics, Chap. 2 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Single-Reference Methods for Excited States in Molecules and Polymers)
    Springer 2008年10月
  13. 13. 物性量子化学入門 重田,育照 (担当:分担執筆, 範囲:第１３、１４章)
    講談社 2004年9月
  1. 1. 理論計算による生体内水素機能メカニズムの解明 堀, 優太; 重田, 育照
    第32回日本MRS年次大会 2022年12月5日 招待有り
  2. 2. 自閉症関連Hevin/Sparcl1変異体は構造不安定性を介して小胞体ストレスを誘導する 武富, 巧; 保田, 拓範; 森田, 陸離; 重田, 育照; 原田, 隆平; 鶴田, 文憲
    第45回日本分子生物学会 2022年11月30日
  3. 3. Chiral symmetry breaking for amino acid homochirality by dimerization 渡辺, 七都稀; 庄司光男; 堀, 優太; 重田, 育照
    Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
  4. 4. heoretical prediction into a possibility of the formation of propylene oxide homochirality 堀, 優太; 渡辺, 七都稀; 庄司光男; 重田, 育照
    Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
  5. 5. 有機分子触媒を用いたアミノ酸ラセミ化反応の理論的研究 渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
    日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
  6. 6. 分子動力学計算に基づくシロイヌナズナおよびエンバクHPPD-メソトリオン複合体の結合挙動解析 宗井, 陽平; 堀, 優太; Hengphasatporn, Kowi; 原田, 隆平; 重田, 育照
    日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
  7. 7. 高電位鉄硫黄タンパク質の電子状態と周辺アミノ酸からの影響 堀, 優太; 佐藤, 綾香; 重田, 育照
    日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
  8. 8. 化学反応ネットワークと機械学習による生成物および反応経路予測の可能性 佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
    第45回ケモインフォマティクス討論会 2022年11月18日
  9. 9. ヒト型アルギニンメチル化酵素PRMT1遺伝子改変マウスの作出とその解析 姚遠; 加香孝一郎; Kowit, Hengphasatporn; 重田育照; 本村香織; 金俊達; 深水, 昭吉
    第95回日本生化学会会 2022年11月9日
  10. 10. Theoretical characterization of the active site and its formation pathway in oxidized [NiFe]-hydrogenase 堀, 優太; 重田, 育照
    第60回 日本生物物理学会年会 2022年9月28日 日本生物物理学会
  11. 11. 高電位鉄硫黄タンパク質の鉄硫黄クラスターの電子状態と周囲のアミノ酸からの影響の理論解析 佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
    第16回分子科学討論会 2022年9月19日
  12. 12. Hydrogen bond structures and dynamics in proton-conducting imidazolium hydrogen succinate Hori, Yuta; Dekura, Shun; Mori, Hatsumi; Shigeta, Yasuteru
    24th International Conference On Horizons In Hydrogen Bond Research (HBond2022) 2022年9月12日
  13. 13. 高電位鉄硫黄タンパク質のクラスター周辺の構造が及ぼす影響と電子状態についての理論的解析 佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
    物性研短期研究会、理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働 2022年7月26日
  14. 14. 酸化型[Ni-Fe]ヒドロゲナーゼの活性中心についての理論的研究 堀, 優太; 重田, 育照
    物性研短期研究会、理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働 2022年7月26日
  15. 15. Integrated experimental-theoretical approaches to decipher how H179Y substitution affects the biological functions of PRMT1 Yao, Yuan; Jun-Dal, Kim; Hiroaki, Daitoku; Naoto, Muromachi; Koichiro, Kako; Junji, Ishida; KowitHengphasatporn; Yasuteru, Shigeta; 深水, 昭吉
    2022年度日本生化学会関東支部例会 2022年6月18日
  16. 16. 高電位鉄硫黄タンパク質の[4Fe-4S]活性中心の構造と電子状態についての理論的解析 堀, 優太; 佐藤, 綾香; 重田, 育照
    第22回日本蛋白質科学会年会 2022年6月7日
  17. 17. 高電位鉄硫黄タンパク質の鉄硫黄クラスター周辺の構造と電子状態についての理論的解析 佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
    量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
  18. 18. アミノ酸ホモキラリティ起源を紐解く結晶形成過程についての量子化学研究 渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
    量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
  19. 19. 酸化型[NiFe]ヒドロゲナーゼの生成過程と活性中心の構造についての理論的研究 堀, 優太; 重田, 育照
    第24回理論化学討論会 2022年5月17日
  20. 20. Theoretical Study on the Active Site in Oxidized [NiFe]-Hydrogenase 堀, 優太; 重田, 育照
    2nd International Symposium “Hydrogenomics” 2022年5月16日
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