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庄司光男

Shoji, Mitsuo

計算科学研究センター , 教授
Center for Computational Sciences , Professor

http://www2.ccs.tsukuba.ac.jp/people/mshoji/

オープンアクセス版の論文は「つくばリポジトリ」で読むことができます。

81. A theoretical study of the formation of glycine via hydantoin intermediate in outer space environment Megumi Kayanuma; Kaori Kidachi; Mitsuo Shoji; Yu Komatsu (+3 著者) Masayuki Umemura
CHEMICAL PHYSICS LETTERS 687: 178 (2017) Semantic Scholar
82. Ab initio computations of zero-field splitting parameters and effective exchange integrals for single-molecule magnets (Mn-12- and Mn11Cr-acetate clusters) Shinsuke Sano; Takashi Kawakami; Shohei Yoshimura; Mitsuo Shoji (+3 著者) Kizashi Yamaguchi
POLYHEDRON 136: 159 (2017) Semantic Scholar
83. Molecular Mechanism of the Reaction Specificity in Threonine Synthase: Importance of the Substrate Conformations. Yuzuru Ujiie; Wataru Tanaka; Kyohei Hanaoka; Ryuhei Harada (+5 著者) Hideyuki Hayashi
The journal of physical chemistry. B 121: 5536 (2017) Semantic Scholar
84. Large-scale QM/MM calculations of the CaMn4O5 cluster in the S-3 state of the oxygen evolving complex of photosystem II. Comparison between water-inserted and no water-inserted structures Mitsuo Shoji; Hiroshi Isobe; Takahito Nakajima; Yasuteru Shigeta (+3 著者) Kizashi Yamaguchi
FARADAY DISCUSSIONS 198: 83 (2017) Semantic Scholar
85. Molecular Mechanism of the Reaction Specificity in Threonine Synthase: Importance of the Substrate Conformations Ujiie Yuzuru; Tanaka Wataru; Hanaoka Kyohei; Harada Ryuhei (+5 著者) Hayashi Hideyuki
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 121: 5536 (2017) Semantic Scholar
86. The reaction mechanism of sarcosine oxidase elucidated using FMO and QM/MM methods Abe, Yukihiro; Shoji, Mitsuo; Nishiya, Yoshiaki; Aiba, Hiroshi (+1 著者) Kitaura, Kazuo
Physical chemistry chemical physics : PCCP 19: 9811 (2017) Semantic Scholar
87. UNO DMRG CASCI calculations of effective exchange integrals for m-phenylene-bis-methylene spin clusters Takashi Kawakami; Shinsuke Sano; Toru Saito; Sandeep Sharma (+6 著者) Kizashi Yamaguchi
MOLECULAR PHYSICS 115: 2154 (2017) Semantic Scholar
88. On the guiding principles for understanding of geometrical structures of the CaMn4O5 cluster in oxygen-evolving complex of photosystem II. Proposal of estimation formula of structural deformations via the Jahn-Teller effects K. Yamaguchi; M. Shoji; H. Isobe; S. Yamanaka (+2 著者) N. Kamiya
MOLECULAR PHYSICS 115: 636 (2017) Semantic Scholar
89. Large-scale QM/MM calculations of the CaMn4O5 cluster in the oxygen-evolving complex of photosystem II: Comparisons with EXAFS structures Mitsuo Shoji; Hiroshi Isobe; Takahito Nakajima; Kizashi Yamaguchi
CHEMICAL PHYSICS LETTERS 658: 354 (2016) Semantic Scholar
90. Molecular Mechanisms of Substrate Specificities of Uridine-Cytidine Kinase Tanaka Wataru; Shoji Mitsuo; Tomoike Fumiaki; Ujiie Yuzuru (+7 著者) Shigeta Yasuteru
BIOPHYSICS AND PHYSICOBIOLOGY 13: 77 (2016) Semantic Scholar
91. プロトンの水和自由エネルギー: 酸解離定数および標準水素電極電位の高精度計算松井, 亨; 喜屋武, 茜; 庄司, 光男; 重田, 育照
Journal of Computer Chemistry, Japan 15: 184 (2016) Semantic Scholar
92. Full geometry optimizations of the CaMn4O4 model cluster for the oxygen evolving complex of photosystem II Mitsuo Shoji; Hiroshi Isobe; Takahito Nakajima; Kizashi Yamaguchi
CHEMICAL PHYSICS LETTERS 640: 23 (2015) Semantic Scholar
93. Molecular dynamics study on the key catalytic intermediates of threonine synthase Mitsuo Shoji; Yuzuru Ujiie; Ryuhei Harada; Megumi Kayanuma (+2 著者) Hideyuki Hayashi
PROTEIN SCIENCE 24: 18 (2015)
94. GPGPU化OpenFMOによるFMO計算の性能評価梅田宏明; 塙敏博; 庄司光男; 朴泰祐重田育照
情報処理学会研究報告(Web) 2015: VOL.2015-HPC-151,NO. (2015)
95. QM/MM study of the S-2 to S-3 transition reaction in the oxygen-evolving complex of photosystem II Mitsuo Shoji; Hiroshi Isobe; Kizashi Yamaguchi
CHEMICAL PHYSICS LETTERS 636: 172 (2015) Semantic Scholar
96. Performance of the divide-and-conquer approach used as an initial guess Mitsuo Shoji; Megumi Kayanuma; Hiroaki Umeda; Yasuteru Shigeta
CHEMICAL PHYSICS LETTERS 634: 181 - 187 (2015) Semantic Scholar
97. A QM/MM study of the 5 '-AMP DNA hydrolysis of aprataxin Kyohei Hanaoka; Wataru Tanaka; Megumi Kayanuma; Mitsuo Shoji
CHEMICAL PHYSICS LETTERS 631: 16 (2015) Semantic Scholar
98. On the guiding principles for lucid understanding of the damage-free S-1 structure of the CaMn4O5 cluster in the oxygen evolving complex of photosystem II Mitsuo Shoji; Hiroshi Isobe; Shusuke Yamanaka; Michihiro Suga (+2 著者) Kizashi Yamaguchi
CHEMICAL PHYSICS LETTERS 627: 44 (2015) Semantic Scholar
99. トレオニン合成酵素の触媒反応前半部分の反応機構解析(第438回研究協議会研究発表要旨,ビタミンB研究委員会) 林, 秀行; 村川, 武志; 庄司, 光男
Vitamins 89: 162 (2015)
100. A QM/MM study of the initial steps of catalytic mechanism of nitrile hydratase Megumi Kayanuma; Kyohei Hanaoka; Mitsuo Shoji; Yasuteru Shigeta
CHEMICAL PHYSICS LETTERS 623: 8 (2015) Semantic Scholar

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