ホーム > 庄司 光男/ Shoji, Mitsuo
庄司 光男
Shoji, Mitsuo
計算科学研究センター , 教授 Center for Computational Sciences , Professor

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庄司光男助教が量子生命科学会令和5年度学会賞を受賞
2023-05-19
庄司 光男

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アミノ酸のホモキラリティ獲得の分子機構を解明〜量子化学計算で生命の起源を探る〜
2023-03-28
庄司 光男

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【受賞】庄司助教が量子生命科学会第4回大会で優秀講演賞を受賞
2022-05-27
庄司 光男

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量子生命科学会第4回大会 優秀ポスター賞
2022-05-27
庄司 光男 堀 優太 重田 育照

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宙に浮く水素イオン?!―大型タンパク質の中性子結晶構造解析で見えた特異な世界―
2020-07-28
庄司 光男
オープンアクセス版の論文は「つくばリポジトリ」で読むことができます。
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141.
Quantum dynamic simulations for single molecular magnets using anisotropic spin models
T. Kawakami; H. Nitta; M. Takahata; M. Shoji (+3 著者) K. Yamaguchi
POLYHEDRON 28: 2092 (2009) Semantic Scholar
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142.
Approximately Spin-Projected Hessian for Broken Symmetry Method and Stretching Frequencies of F-2 and Singlet O-2
Kitagawa Yasutaka; Saito Toru; Nakanishi Yasuyuki; Kataoka Yusuke (+4 著者) Yamaguchi Kizashi
International Journal of Quantum Chemistry 109: 3641 (2009) Semantic Scholar
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143.
Extended Hartree-Fock Theory of Chemical Reactions. IX. Diradical and Perepoxide Mechanisms for Oxygenations of Ethylene With Molecular Oxygen and Iron-Oxo Species Are Revisited
Yamaguchi Kizashi; Yamanaka Syusuke; Shimada Jiro; Isobe Hiroshi (+3 著者) Okumura Mitsutaka
International Journal of Quantum Chemistry 109: 3745 (2009) Semantic Scholar
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144.
Theory of Chemical Bonds in Metalloenzymes XIII: Singlet and Triplet Diradical Mechanisms of Hydroxylations With Iron-Oxo Species and P450 are Revisited
Yamaguchi Kizashi; Yamanaka Syusuke; Isobe Hiroshi; Shoji Mitsuo (+3 著者) Shimada Jiro
International Journal of Quantum Chemistry 109: 3723 (2009) Semantic Scholar
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145.
Theory of chemical bonds in metalloenzymes XII: Electronic and spin structures of metallo-oxo and isoelectronic species and spin crossover phenomena in oxygenation reactions
Yamaguchi Kizashi; Shoji Mitsuo; Isobe Hiroshi; Yamanaka Syusuke (+2 著者) Okumura Mitsutaka
Polyhedron 28: 2044 (2009) Semantic Scholar
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146.
Theoretical Studies on Effects of Hydrogen Bonds Attaching to Cysteine Ligands on 4Fe-4S Clusters
Kitagawa; M. Shoji; T. Saito; Y. Nakanishi (+3 著者) K. Yamaguchi
International Journal of Quantum Chemistry 108: 2881 (2008) Semantic Scholar
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147.
Theoretical studies on the structure and effective exchange integral (J(ab)) of an active site in oxyhemocyanin (oxyHc) by using approximately spin-projected geometry optimization (AP-opt) method
T. Saito; Y. Kitagawa; M. Shoji; Y. Nakanishi (+3 著者) K. Yamaguchi
Chemical Physics Letters 456: 76 (2008) Semantic Scholar
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148.
Theoretical investigation of the magnetic interactions of Ni-9 complexes
Shoji Mitsuo; Kitagawa Yasutaka; Kawakami Takashi; Yamanaka Shusuke (+1 著者) Yamaguchi Kizashi
Journal of Physical Chemistry a 112: 4020 (2008) Semantic Scholar
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149.
Theory of Chemical Bonds in Metalloenzymes XI: Full Geometry Optimization and Vibration Analysis of Porphyrin Iron-Oxo Species
Shoji Mitsuo; Isobe Hiroshi; Saito Toru; Kitagawa Yasutaka (+3 著者) Yamaguchi Kizashi
International Journal of Quantum Chemistry 108: 2950 (2008) Semantic Scholar
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150.
Theory of chemical bonds in metalloenzymes. VII. Hybrid-density functional theory studies on the electronic structures of P450
Shoji Mitsuo; Isobe Hiroshi; Saito Toru; Yabushita Hirotaka (+6 著者) Yamaguchi Kizashi
International Journal of Quantum Chemistry 108: 631 (2008) Semantic Scholar
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151.
Extended hartree-fock theory of chemical reactions. VIII. hydroxylation reactions by P450
Hiroshi Isobe; Satomichi Nishihara; Mitsuo Shoji; Shusuke Yamanaka (+2 著者) Kizashi Yamaguchi
International Journal of Quantum Chemistry 108: 2991 (2008) Semantic Scholar
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152.
Density functional study of manganese dimer
Shusuke Yamanaka; Takeshi Ukai; Kazuto Nakata; Ryo Takeda (+3 著者) Kizashi Yamaguchi
INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY 107: 3178 (2007) Semantic Scholar
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153.
Ab initio studies on the zero-field splitting parameters of manganese porphyrin complexes
Ryo Takeda; K. Koizumi; M. Shoji; H. Nitta (+2 著者) K. Yamaguchi
POLYHEDRON 26: 2309 (2007) Semantic Scholar
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154.
Ab initio calculation of the Dzyaloshinskii-Moriya parameters: Spin-orbit GSO-HF, HFT, and CI approaches
R. Takeda; S. Yamanaka; M. Shoji; K. Yamaguchi
INTERNATIONAL JOURNAL OF QUANTUM CHEMISTRY 107: 1328 (2007) Semantic Scholar
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155.
Quantum spin correction scheme based on spin-correlation functional for Kohn-Sham spin density functional theory
Shusuke Yamanaka; Ryo Takeda; Kazuto Nakata; Toshikazu Takada (+2 著者) Kizashi Yamaguchi
JOURNAL OF MAGNETISM AND MAGNETIC MATERIALS 310: E492 (2007) Semantic Scholar
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156.
A GSO-HDFT study of noncollinear spin structures of [2Fe-2S] cluster
Shoji Mitsuo; Koizumi Kenichi; Takeda Ryo; Kitagawa Yasutaka (+2 著者) Yamaguchi Kizashi
Polyhedron 26: 2335 (2007) Semantic Scholar
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157.
Assignments of the Mossbauer spectra of an inorganic [8fe-7S] complex based on the first-principle calculations
Shoji Mitsuo; Saito Toru; Takeda Ryo; Kitagawa Yasutaka (+3 著者) Yamaguchi Kizashi
Chemical Physics Letters 446: 228 (2007) Semantic Scholar
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158.
Geometry optimization method based on approximate spin projection and its application to F(2), CH(2), CH(2)OO, and active site of urease
Kitagawa Yasutaka; Saito Toru; Ito Masahide; Nakanishi Yasuyuki (+5 著者) Yamaguchi Kizashi
International Journal of Quantum Chemistry 107: 3094 (2007) Semantic Scholar
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159.
Theoretical studies on ferromagnetic behavior of [Cr(C-5(CH3)(5))(2)](+)[TCNE](-) and [Mn(C-5(CH3)(5))(2)](+)[TCNQ](-)
Koizumi Kenichi; Shoji Mitsuo; Kitagawa Yasutaka; Takeda Ryo (+3 著者) Yamaguchi Kizashi
Polyhedron 26: 2135 (2007) Semantic Scholar
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160.
Theory of chemical bonds in metalloenzymes. IX. Theoretical study on the active site of the ribonucieotide reductase and the related species
Shoji Mitsuo; Isobe Hiroshi; Takano Yu; Kitagawa Yasutaka (+2 著者) Yamaguchi Kizashi
International Journal of Quantum Chemistry 107: 3250 (2007) Semantic Scholar
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1.
生体の科学
庄司, 光男
医学書院 2024年6月
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2.
分子シミュレーション学会会誌アンサンブル
庄司, 光男
分子シミュレーション学会 2024年4月
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3.
フロンティア
庄司, 光男
理論化学会 2024年1月
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4.
フロンティア
庄司, 光男
理論化学会 2024年1月
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5.
フロンティア
庄司, 光男
理論化学会 2024年1月
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6.
ADVANCES IN QUANTUM CHEMISTRY, VOL 84
Yamaguchi, Kizashi; Miyagawa, Koichi; Isobe, Hiroshi; Shoji, Mitsuo; Kawakami, Takashi; Yamanaka, Shusuke
ELSEVIER ACADEMIC PRESS INC 2021年 (ISBN: 9780128238776)
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7.
環境技術
庄司,光男
(担当:分担執筆, 範囲:量子化学計算ビギナーズガイド)
2020年10月
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8.
量子化学計算ビギナーズガイド
庄司光男
環境技術, 環境技術学会 2020年10月
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9.
Gaussian16で始める量子化学超入門
庄司, 光男
Amazon Kindle direct publishing 2020年4月
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10.
フリーソフトで始める分子モデリング
庄司, 光男
Amazon Kindle direct publishing 2020年4月
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1.
Chiral symmetry breaking for amino acid homochirality by dimerization
渡辺, 七都稀; 庄司光男; 堀, 優太; 重田, 育照
Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
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2.
heoretical prediction into a possibility of the formation of propylene oxide homochirality
堀, 優太; 渡辺, 七都稀; 庄司光男; 重田, 育照
Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
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3.
有機分子触媒を用いたアミノ酸ラセミ化反応の理論的研究
渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
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4.
分子動力学計算に基づくシロイヌナズナおよびエンバクHPPD-メソトリオン複合体の結合挙動解析
渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
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5.
Natural selection of the Mn cluster in the photosynthetic water oxidation
Mitsuo Shoji
Satellite Meeting to 18th International Congress on Photosynthesis Research (WOX-ICPR2022) 2022年8月7日 招待有り
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6.
QM/MM study of the role of valine 185 in the oxygen-evolving center of photosystem II
M.Shoji; K.Miyagawa; H.Isobe; Y.Shigeta; K.Yamaguchi
18th International Congress on Photosynthesis Research (ICPR2022) 2022年8月4日
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7.
GLASアルゴリズムによる酵素反応機構の理論解明:新規反応経路探索手法の開発と適用
庄司光男
物性研短期研究会「理論タンパク質物性科学の最前線:理論と実験との密な協働」 2022年7月27日 招待有り
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8.
銅含有アミン酸化酵素におけるトパキノン補酵素の構造変化機構
庄司光男
第22回日本蛋白質科学会年会 2022年6月8日
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9.
光合成水分解酸素発生におけるMnの自然選択の理由
庄司光男; 宮川晃一; 三嶋謙二; 堀優太; 重田育照
量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
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10.
アミノ酸ホモキラリティ起源を紐解く結晶形成過程についての量子化学研究
渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
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11.
Theoretical insights into the molecular mechanisms of dynamical biochemical reactions
Mitsuo Shoji
Molecular Movies International Symposium 2022 2022年5月13日
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12.
QM/MM study of the large conformational change of quinone cofactor during the catalytic cycle of bacterial copper amine oxidases
Shoji, Mitsuo
2022 LBNL/CSA - Tsukuba/CCS Collaboration Meeting 2022年3月 LBNL/CSA 招待有り
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13.
自然・半導体・分子触媒で利用可能な多様な水分解反応機構の解明
Shoji, Mitsuo
I4LEC 第4回公開シンポジウム 2022年3月 新学術領域I4LEC
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14.
銅アミン酸化酵素におけるドパキノン補酵素のコンフォメーション制御機構
Shoji, Mitsuo
量子生命科学先端フォーラム2021冬の研究会 2021年12月 量子生命科学会
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15.
結晶成長によるアミノ酸キラル増幅に関する理論的研究
渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2021年秋季年会 2021年11月2日
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16.
GLAS 法による分子構造及び化学反応経路の探索
庄司, 光男
日本コンピュータ化学会2021年秋季年会 2021年11月2日
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17.
隕石中でのアミノ酸キラル増幅機構についての理論的研究
渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
第15回分子科学討論会 2021年9月18日
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18.
銅含有アミン酸化酵素におけるセミキノンラジカル生成機構の理論解明
Shoji, Mitsuo
I4LEC 第4回公開シンポジウム 2021年9月16日 量子生命科学会
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19.
酸化型[NiFe]ヒドロゲナーゼ活性中心の電子状態計算
堀, 優太; 石川, 航平; 庄司, 光男; 重田, 育照
量子生命科学会第3回大会 2021年9月16日
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20.
銅含有アミン酸化酵素のプロトン化状態についてのQM/MM解析
庄司, 光男
第47回生体分子科学討論会 2021年6月4日
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