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石田健一郎

ISHIDA, Ken-ichiro

生命環境系 , 教授
Faculty of Life and Environmental Sciences , Professor

http://www.biol.tsukuba.ac.jp/~ken/

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1. Taxonomic re-evaluation of the Braarudosphaera bigelowii species complex (Prymnesiophyceae) Hagino, Kyoko; Takano, Yoshihito; Wakeman, Kevin C.; Horiguchi, Takeo (+16 著者) Zehr, Jonathan P.
Phycologia 65: 159 (2026)
2. Production of fucoxanthin using a water surface-floating microalga Chromophyton sp. (Hikarimo) Umehara, Akira; Wahab, Mardhiah; Yoneda, Kohei; Akhir, Fazrena (+10 著者) Maeda, Yoshiaki
Journal of bioscience and bioengineering 141: 49 (2025) Semantic Scholar
3. Glissandra oviformis n. sp.: a novel predatory flagellate illuminates the character evolution within the eukaryotic clade CRuMs. Yazaki, Euki; Harada, Ryo; Isogai, Ryu; Bamba, Kohei (+2 著者) Shiratori, Takashi
Open Biology 15: 250057 (2025)
4. A novel free-living endomyxan flagellate Viscidocauda repens gen. Nov., sp. nov Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-ichiro
PROTIST 177: (2025) Semantic Scholar
5. An expanded phylogenomic analysis of Heterolobosea reveals the deep relationships, non-canonical genetic codes, and cryptic flagellate stages in the group. Pánek, Tomáš; Tice, Alexander K.; Corre, Pia; Hrubá, Pavla (+13 著者) Čepička, Ivan
Molecular Phylogenetics and Evolution 204: 108289 (2025)
6. Meteora sporadica, a protist with incredible cell architecture, is related to Hemimastigophora Eglit, Yana; Shiratori, Takashi; Jerlström-Hultqvist, Jon; Williamson, Kelsey (+3 著者) Alastair G B
CURRENT BIOLOGY 34: 451-459.e6 (2024)
7. Rhabdamoeba marina is a heterotrophic relative of chlorarachnid algae Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-Ichiro
JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY Epub: (2023) Semantic Scholar
8. Molecular and morphological characterization of three novel Minorisa species (Chlorarachnea) and proposal for an emended description of the Minorisa minuta. SHIRATORI, Takashi; KATO, Yuta; ISHIDA, Ken-ichiro
Phycological Research (2023)
9. One high quality genome and two transcriptome datasets for new species of Mantamonas, a deep-branching eukaryote clade Blaz, Jazmin; Galindo, Luis Javier; Heiss, Aaron A; Kaur, Harpree (+12 著者) Eme, Laura
SCIENTIFIC DATA 10: 603 (2023) Semantic Scholar
10. Molecular and morphological characterization of four new ancyromonad genera and proposal for an updated taxonomy of the Ancyromonadida Yubuki, Naoji; Torruella, Guifre; Galindo, Luis Javier; Heiss, Aaron A (+8 著者) Eme, Laura
JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY Epub: (2023)
11. Unstable Relationship Between Braarudosphaera bigelowii (= Chrysochromulina parkeae) and Its Nitrogen-Fixing Endosymbiont Suzuki, Shigekatsu; Kawachi, Masanobu; Tsukakoshi, Chinatsu; Nakamura, Atsushi (+2 著者) Ishida, Ken-ichiro
FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 12: 749895 (2021) Semantic Scholar
12. Barthelonids represent a deep-branching metamonad clade with mitochondrion-related organelles predicted to generate no ATP Euki, Yazaki; Kume, Keitaro; Takashi, Shiratori; Yana, Eglit (+5 著者) Inagaki, Yuji
Proceedings of the Royal Society B 287: 20201538 (2020) Semantic Scholar
13. Morphology, Ultrastructure, and Phylogeny of Two Novel Species of Ventrifissura (V. oblonga n. sp. and V. velata n. sp., Thecofilosea, Cercozoa) Shiratori, Takashi; Yabuki, Akinori; Ishida, Ken-Ichiro
Protist (2020)
14. Morphology, Ultrastructure, and Phylogeny of Two Novel Species of Ventrifissura (V. oblonga n. sp. and V. velata n. sp., Thecofilosea, Cercozoa) Shiratori, Takashi; Yabuki, Akinori; Ishida, Ken-Ichiro
Protist (2020)
15. Mitochondrial genomes of Hemiarma marina and Leucocryptos marina revised the evolution of cytochrome c maturation in Cryptista. Yuki, Nishimura; Keitaro, Kume; Keito, Sonehara; Goro, Tanifuji (+4 著者) Moriya, Ohkuma
Frontiers in Ecology and Evolution 8: 140 (2020) Semantic Scholar
16. Morphology, Ultrastructure, and Phylogeny of Two Novel Species of Ventrifissura (V. oblonga n. sp. and V. velata n. sp., Thecofilosea, Cercozoa) Shiratori, Takashi; Yabuki, Akinori; Ishida, Ken-Ichiro
Protist 171: 125731 (2020) Semantic Scholar
17. Dinoflagellates with relic endosymbiont nuclei as models for elucidating organellogenesis. Sarai, Chihiro; Tanifuji, Goro; Nakayama, Takuro; Kamikawa, Ryoma (+6 著者) Inagaki, Yuji
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117: 5364 (2020) Semantic Scholar
18. Fine Structure Observation of Feeding Behavior, Nephroselmis spp.-derived Chloroplast Enlargement, and Mitotic Processes in the Katablepharid Hatena arenicola Nomura, Mami; Kamikawa, Ryoma; Ishida, Ken-Ichiro
Protist 171: 125714 (2020) Semantic Scholar
19. Fine Structure Observation of Feeding Behavior, Nephroselmis spp.-derived Chloroplast Enlargement, and Mitotic Processes in the Katablepharid Hatena arenicola Nomura, Mami; Kamikawa, Ryoma; Ishida, Ken-Ichiro
Protist 171: (2020) Semantic Scholar
20. Phagocytosis-like cell engulfment by a planctomycete bacterium SHIRATORI, Takashi; SUZUKI, Shigekatsu; KAKIZAWA, Yukako; ISHIDA, Ken-ichiro
Nature Communications 10: 5529 (2019) Semantic Scholar

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21. アルベオラータと不等毛藻の葉緑体は共通の起源から進化した石田健一郎 (担当:単訳)
藻類藻類 2001年1月
22. 葉緑体の誕生は一回だった？石田健一郎 (担当:監修)
藻類藻類 2000年1月
23. ルビスコ遺伝子群の複雑な進化石田健一郎 (担当:監修)
藻類藻類 2000年1月
24. 二次共生由来の葉緑体へのタンパク質輸送機構ーユーグレナの場合ー石田健一郎 (担当:監修)
藻類藻類 2000年1月
25. 共生核の運命石田健一郎
バイオディバーシティ・シリーズ３藻類の多様性と系統バイオディバーシティ・シリーズ３藻類の多様性と系統裳華房 1999年1月
26. 葉緑体包膜の起源石田健一郎 (担当:監修)
藻類藻類 1999年1月
27. クロララクニオン植物門．原慶明; 石田健一郎
バイオディバーシティ・シリーズ３藻類の多様性と系統バイオディバーシティ・シリーズ３藻類の多様性と系統裳華房 1999年1月
28. クロララクニオン植物門．石田健一郎
藻類多様生の生物学藻類多様生の生物学内田老鶴圃 1997年1月
29. Taxonomy and Molecular Phylogeny of the Chlorarachniophyta 石田, 健一郎
1996年7月
30. クロラクニオン藻綱石田健一郎
週刊朝日百科「植物の世界ー139号藻類緑藻類」週刊朝日百科「植物の世界ー139号藻類緑藻類」朝日新聞社 1996年1月
31. クロラクニオン藻綱 Chlorarachniophyceae．石田健一郎
藻類の生活史集成第３巻単細胞性・鞭毛藻類藻類の生活史集成第３巻単細胞性・鞭毛藻類内田老鶴舗 1993年1月
32. ヌクレオモルフー新しい細胞像ー原慶明; 恵良田真由美; 石田健一郎 (担当:監修)
植物細胞工学植物細胞工学 1992年1月

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1. 新奇ミトコンドリア局在DNAポリメラーゼが示唆するマラウィモナス類、アンキロモナス類、ディスコバ類の近縁性と真核生物のルート原田亮; Eliáš, Marek; 中野健太郎; 白鳥峻志; 矢吹彬憲; Ensoo, Kim; 石田健一郎; 稲垣, 祐司
第81回日本寄生虫学会東日本支部大会・日本共生生物学会第6回大会 2022年10月1日
2. フィロジェノミック解析により推測されたMicroheliella marisの系統的位置．矢﨑裕規; 今泉彩香; 久米慶太郎; 白鳥峻志; 橋本哲男; 矢吹彬憲; 石田健一郎; 稲垣, 祐司
第3回日本共生学会大会 2019年11月19日
3. Re-exploration of the protein performing plant-type C-to-U RNA editing in diverse eukaryotes. 西村祐貴; 佐藤渚; 白鳥峻志; 石田健一郎; 橋本哲男; 稲垣, 祐司; 大熊盛也
14th International Colloquium on Endocytobioogy and Symbiosis 2019年9月1日
4. Distribution of plant-type mitochondrial C-to-U RNA editing in diverse eukaryotes. 西村祐貴; 佐藤渚; 白鳥峻志; 石田健一郎; 橋本哲男; 稲垣, 祐司; 大熊盛也
日本進化学会第21回大会 2019年8月7日
5. Phylogenomic analysis assessing the position of "orphans" including Microheliella maris. Euki, Yazaki; Ayaka, Imaizumi; Keitaro, Kume; Takashi, Shiratori; Tetsuo, Hashimoto; Akinori, Yabuki; Ken-ichiro, Ishida; Inagaki, Yuji
VIII European Congress of Protistology 2019年7月28日
6. 有中心粒太陽虫類におけるミトコンドリアゲノムの比較解析. 西村祐貴; 佐藤渚; 白鳥峻志; 石田健一郎; 橋本哲男; 稲垣, 祐司; 大熊盛也
日本微生物資源学会第26回大会 2019年6月27日
7. 新奇原生生物SRT308株が明らかにするユーグレノゾアの初期進化. 白鳥峻志; 矢崎裕規; 久米慶太郎; 石田健一郎; 橋本哲男; 稲垣, 祐司
第43回日本藻類学会会 2019年3月15日
8. 有殻アメーバのゲノム解析から見えてきた一次細胞内共生進化におけるDNAウイルスの役割．松尾充啓; 潟端篤; 立川誠; 水口洋平; 野口英樹; 豊田敦; 藤山秋佐夫; 鈴木穣; 佐藤壮一郎; 中山卓郎; 神川龍馬; 野村真実; Inagaki, Yuji; 石田健一郎; 小保方潤一
日本共生生物学会第2回大会 2018年11月24日
9. Orphan protistology, accelerating in Japan. Shiratori, Takashi; Yabuki, Akinori; Yazaki, Euki; Nishimura, Yuki; Ohkuma, Moriya; Fujikura, Katsunori; Hashimoto, Tetsuo; Inagaki, Yuji; Ishida, Ken-ichiro
Joint meeting of the Japan Society of Protistology and the Korean Society of Protozoologists 2018年7月13日
10. A novel predatory bacterium and the early evolution of eukaryotes ISHIDA, Ken-ichiro; SHIRATORI, Takashi; Suzuki, Shigekatsu; KAKIZAWA, Yukako
Joint meeting of the Korean Society of Protistologists and Japan Society of Protistology 2018年7月13日
11. 新奇捕食性バクテリアの細胞における運動について石田, 健一郎; 白鳥, 峻志; 柿澤侑花子
日本微生物生態学会第32回大会 2018年7月12日
12. 新奇捕食性バクテリアCandidatus "Uab amorphum" の形態およびゲノム特性について石田, 健一郎; 白鳥, 峻志; 鈴木重勝; 柿澤侑花子
日本微生物生態学会第32回大会 2018年7月12日
13. Evolutionary roles of SL-trans-splicing in the primary endosymbiosis. Matsuo, Mitsuhiro; Katahata, Atsushi; Satoh, Soichirou; Matsuzaki, Motomichi; Matsui, Mami; Ken-ichiro, Ishida; 稲垣, 祐司; Obokata, Junichi
Genome Evolution at Mishima 2017年3月27日
14. 火山噴火による西之島の植物の完全な消失と新たな侵入について上條, 隆志; 南波, 紀昭; 武, 彩海; 半田, 信司; 石田健一郎; 森, 英章; 川上, 和人; 中野, 智之
日本地球惑星科学連合2025年大会
15. “新生”西之島から最初に発見された藻類：その同定と侵入種としての特性武彩海; 南波紀昭; 半田信司; 森英章; 上條隆志; 石田, 健一郎
日本植物学会第89回大会（福岡）
16. 藻類に対して未使用の培地（培地Y）のボトリオコッカスおよびヘマトコッカスの増殖に対する有効性 Yujun, WANG; 石田, 健一郎
日本植物学会第89回大会（福岡）
17. 炭化水素産生藻Botryococcus braunii NIES-836の増殖と脂質蓄積に対する“培地Y”の有効性 Yujun, WANG; 石田, 健一郎
日本藻類学会第50回大会（つくば）
18. プラシノ藻類Nephroselmis sp.に見られる捕食行動のハイスピード解析と食作用に関連する細胞微細構造中野拓斗; 白鳥, 峻志; 石田健一郎
第28回日本サンゴ礁学会・第9回日本共生生物学会合同大会
19. 捕食性細菌Candidatus Uabimicrobiumの比較ゲノム解析大沼万優子; 鈴木重勝; 石田健一郎; 白鳥, 峻志
第28回日本サンゴ礁学会・第9回日本共生生物学会合同大会
20. 新生物発見が微生物多様性の常識を変える ISHIDA, Ken-ichiro
第40回国際生物学賞記念シンポジウム「系統学と分類学 ― 植物・動物・菌類・藻類・微生物を含む多様な生物の世界」招待有り