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中山卓郎

Nakayama, Takuro

計算科学研究センター , 助教
Center for Computational Sciences , Assistant Professor

オープンアクセス版の論文は「つくばリポジトリ」で読むことができます。

21. Genome sequencing reveals metabolic and cellular interdependence in an amoeba-kinetoplastid symbiosis Goro Tanifuji; Ugo Cenci; Daniel Moog; Samuel Dean (+15 著者) John M. Archibald
SCIENTIFIC REPORTS 7: 11688 (2017) Semantic Scholar
22. Evolution of UhpC-type hexose-phosphate transporters in dinoflagellates Yoshihisa Hirakawa; Takuro Nakayama; Nadine Keilert; Ken-ichiro Ishida
PHYCOLOGICAL RESEARCH 65: 166 (2017) Semantic Scholar
23. Diversity of the Photosynthetic Paulinella Species, with the Description of Paulinella micropora sp nov and the Chromatophore Genome Sequence for strain KR01 Duckhyun Lhee; Eun Chan Yang; Jong Im Kim; Takuro Nakayama (+2 著者) Hwan Su Yoon
PROTIST 168: 155 (2017) Semantic Scholar
24. シアノバクテリアと真核藻類の細胞統合―「窒素固定オルガネラ」へ続く道？中山卓郎; 稲垣,祐司
生物の科学遺伝 70: 176 (2016)
25. Metabolic Capacity of Mitochondrion-related Organelles in the Free-living Anaerobic Stramenopile Cantina marsupialis Fumiya Noguchi; Shigeru Shimamura; Takuro Nakayama; Euki Yazaki (+4 著者) Kiyotaka Takishita
PROTIST 166: 534 (2015) Semantic Scholar
26. Complete genome of a nonphotosynthetic cyanobacterium in a diatom reveals recent adaptations to an intracellular lifestyle Takuro Nakayama; Ryoma Kamikawa; Goro Tanifuji; Yuichiro Kashiyama (+2 著者) Yuji Inagaki
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 111: 11407 (2014) Semantic Scholar
27. Detailed Process of Shell Construction in the Photosynthetic Testate Amoeba Paulinella chromatophora ( Euglyphid, Rhizaria) Mami Nomura; Takuro Nakayama; Ken-ichiro Ishida
JOURNAL OF EUKARYOTIC MICROBIOLOGY 61: 317 (2014) Semantic Scholar
28. Genetic structure of Japanese Chattonella marina (Raphidophyceae) populations revealed using microsatellite markers Mikihide Demura; Takuro Nakayama; Fumie Kasai; Masanobu Kawachi
PHYCOLOGICAL RESEARCH 62: 102 (2014) Semantic Scholar
29. Unique genome evolution in an intracellular N-2-fixing symbiont of a rhopalodiacean diatom Takuro Nakayama; Yuji Inagaki
ACTA SOCIETATIS BOTANICORUM POLONIAE 83: 409 (2014) Semantic Scholar
30. Algal genomes reveal evolutionary mosaicism and the fate of nucleomorphs Bruce A. Curtis; Goro Tanifuji; Fabien Burki; Ansgar Gruber (+68 著者) John M. Archibald
NATURE 492: 59 (2012) Semantic Scholar
31. Broad Distribution of TPI-GAPDH Fusion Proteins among Eukaryotes: Evidence for Glycolytic Reactions in the Mitochondrion? Takuro Nakayama; Ken-ichiro Ishida; John M. Archibald
PLOS ONE 7: e52340 (2012) Semantic Scholar
32. Evolving a photosynthetic organelle Takuro Nakayama; John M. Archibald
BMC BIOLOGY 10: 35 (2012) Semantic Scholar
33. Succession of genetic diversity of Botryococcus braunii (Trebouxiophyceae) in two Japanese reservoirs Mikihide Demura; Masanobu Kawachi; Hiroshi Koshikawa; Takuro Nakayama (+1 著者) Makoto M. Watanabe
INNOVATIVE RESEARCHES ON ALGAL BIOMASS 15: 3 (2012) Semantic Scholar
34. Tsukubamonas globosa gen. et sp. nov.; a novel excavate flagellate possibly hold a key for the early evolution in “Discoba”. Yabuki, A; Nakayama, T; Yubuki, N; Hashimoto, T (+1 著者) Inagaki, Y
J. Euk. Microbiol. 58: 94-102 (2011)
35. Cercozoa comprises both EF-1 alpha-containing and EFL-containing members Ryoma Kamikawa; Akinori Yabuki; Takuro Nakayama; Ken-ichiro Ishida (+1 著者) Yuji Inagaki
EUROPEAN JOURNAL OF PROTISTOLOGY 47: 24 (2011) Semantic Scholar
36. Spheroid bodies in rhopalodiacean diatoms were derived from a single endosymbiotic cyanobacterium Takuro Nakayama; Yuko Ikegami; Takeshi Nakayama; Ken-ichiro Ishida (+1 著者) Isao Inouye
JOURNAL OF PLANT RESEARCH 124: 93 (2011) Semantic Scholar
37. Differential Gene Retention in Plastids of Common Recent Origin Adrian Reyes-Prieto; Hwan Su Yoon; Ahmed Moustafa; Eun Chan Yang (+4 著者) Debashish Bhattacharya
MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 27: 1530 (2010) Semantic Scholar
38. PHYLOGENETIC POSITION OF SYMBIOTIC CHLORELLA (TREBOUXIOPHYCEAE, CHLOROPHYTA) OF MAYORELLA VIRIDIS (AMOEBOZOA) AND ITS SYMBIOTIC MANNER T. Nishimura; H. Yamaguchi; Y. Kodama; Takuro Nakayama (+1 著者) I. Inouye
PHYCOLOGIA 48: 94 (2009)
39. A single origin of the photosynthetic organelle in different Paulinella lineages Hwan Su Yoon; Takuro Nakayama; Adrian Reyes-Prieto; Robert A. Andersen (+2 著者) Debashish Bhattacharya
BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY 9: 98 (2009) Semantic Scholar
40. Another acquisition of a primary photosynthetic organelle is underway in Paulinella chromatophora Takuro Nakayama; Ken-ichiro Ishida
CURRENT BIOLOGY 19: R284 (2009) Semantic Scholar

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1. 原生生物学事典中山, 卓郎
朝倉書店 2023年5月 (ISBN: 4254171811)

1. 栽培される共生体：海洋渦鞭毛藻とシアノバクテリアの共生関係中山, 卓郎
日本植物学会第86回大会 2022年9月17日
2. Paulinella microporaにおけるマイクロボディの局在とその機能推定野村, 真未; 中山, 卓郎; 中村, 桂一郎; 太田, 啓介
日本植物学会第86回大会 2022年9月17日
3. Draft nucleomorph genomes of green-colored dinoflagellates Inagaki, Yuji; Nakayama, Takuro; Kawakubo, Takashi; Matsuo, Eriko; Takahashi, Kazuya; Iwataki, Mitsunori
21st Symposium of the International Society of Endocytobiology 2022年7月19日招待有り
4. 緑色渦鞭毛藻Lepidodinium chlorophorumにおけるヌクレオモルフゲノムの存在検証中山卓郎; 稲垣, 祐司
日本藻類学会第46回大会 2022年3月29日
5. 緑色渦鞭毛藻Lepidodinium chlorophorumにおけるヌクレオモルフゲノムの存在検証中山卓郎; 稲垣, 祐司
日本藻類学会第46回大会 2022年3月29日
6. 様々なヘテロ接合度の生物を用いたハプロイドセット構築のためのゲノムアセンブリ手法の評価望月, 孝子; 坂本, 美佳; 谷澤, 靖洋; 中山, 卓郎; 谷藤, 吾朗; 神川, 龍馬; 中村, 保一
日本分子生物学会年会 2021年12月1日
7. 緑色渦鞭毛藻3種のペディノ藻由来色素体ゲノム間での共通性と特異性松尾恵梨子; 森田幸之介; 中山卓郎; 皿井千裕; 高橋和也; 岩滝光儀; 稲垣, 祐司
日本共生生物学会第5回大会 2021年11月27日
8. 原生生物に共生するシアノバクテリアの進化と多様性に関する研究中山, 卓郎
日本植物学会第85回大会 2021年9月18日
9. On the tree of Archaeplastida: The impact of rapidly evolving and heterotachious positions on nuclear and plastid phylogenomic inferences. Isogai, Ryu; Harada, Ryo; Nakayama, Takuro; INAGAKI, Yuji
ICOP/ISEP2025
10. Nucleomorph genome of the dinoflagellate TGD reveals an early stage of genome reduction following secondary endosymbiosis. Fujishiro, Ayaka; Isogai, Ryu; Suzuki, Shigekatsu; Takahashi, Kazuya; Iwataki, Mitsunori; INAGAKI, Yuji; Nakayama, Takuro
ICOP/ISEP2025
11. Recent plastid replacement in Karlodinium ballantinum (Kareniaceae, Dinoflagellata) challenges the paradigms of endosymbiotic gene transfer. Maciszewski, Kacper; Takahashi, Kazuya; Harada, Ryo; Martinek, Inga; Nakayama, Takuro; Iwataki, Mitsunori; INAGAKI, Yuji; Hehenberger, Elisabeth
ICOP/ISOP2025
12. Thermoproteota門古細菌におけるPCNA進化．上西慧莉紗; 原田亮; 中山卓郎; 稲垣, 祐司
第37回Archaea研究会
13. tARP is an actin-related protein required for ciliary function that is conserved in ciliates and related eukaryotic groups. Kagawa, Miku; Takuro, Nakayama; Shiba, Kogiku; Takako, Kato-Minoura; Matsuda, Shinya; Inaba, Kazuo; INAGAKI, Yuji; Kentaro, Nakano
第77回日本細胞生物学会・第58回日本発生生物学会合同大会
14. 光合成をやめたシアノバクテリアのゲノム進化中山, 卓郎
大隅基礎科学創成財団微生物機能探究コンソーシアムG4定例会招待有り
15. 緑色渦鞭毛藻TGD株のヌクレオモルフゲノムが示す二次共生ゲノム進化の新たなスナップショット藤代彩花; 磯貝龍邑; 鈴木重勝; 高橋和也; 岩滝光儀; 稲垣, 祐司; 中山卓郎
日本植物学会第89回大会
16. Hidden microbial diversity: Novel microbial lineages discovered in dinoflagellate symbioses NAKAYAMA, Takuro
AIMEC Science Salon 招待有り
17. 珪藻に共生する窒素固定シアノバクテリアと「ニトロプラスト」中山, 卓郎
藍藻の分子生物学2024 招待有り
18. 単細胞ゲノム増幅産物から発見された極小古細菌ゲノム．原田亮; 西村祐貴; 野村真未; 矢吹彬憲; 稲垣, 祐司; 中山卓郎
日本微生物生態学会第37回大会
19. 原生生物の核ゲノム転写物におけるRNA Editingの探索．磯貝龍邑; 原田亮; 矢﨑裕規; 中山卓郎; 稲垣, 祐司; 矢吹彬憲
日本共生生物学会第8回大会
20. Metamonadaとの近縁性が示唆される好気性原生生物の系統分類学的研究．白鳥峻志; 原田亮; 磯貝龍邑; 中山卓郎; 稲垣, 祐司
日本共生生物学会第8回大会