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重田 育照
Shigeta, Yasuteru
計算科学研究センター , 教授 Center for Computational Sciences , Professor
http://www2.ccs.tsukuba.ac.jp/public/shigeta/shigeta_HP/Top_page.html
http://www2.ccs.tsukuba.ac.jp/people/shigeta/shigeta_personal/Message.html
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ISSM best paper
2024-12-10
上殿 明良 蓮沼 隆 重田 育照
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可逆性小児急性肝不全の発症機序の解明-治療薬開発に向けた道筋-
2023-12-27
重田 育照
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量子生命科学会第4回大会 優秀ポスター賞
2022-05-27
庄司 光男 堀 優太 重田 育照
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凝集したタンパク質を元に戻す分子Hsp104 の構造を解明
2021-05-11
重田 育照
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スーパーコンピュータを活用して「効く薬の候補」を素早く見つけ出す | 重田 育照
2021-04-01
重田 育照 広川 貴次 原田 隆平
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1兆分の1秒の時間分解能で液晶分子の動画を観測 -新しい測定・解析手法の確立
2018-02-13
重田 育照
オープンアクセス版の論文は「つくばリポジトリ」で読むことができます。
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341.
Theoretical design of solvatochromism switching by photochromic reactions using donor-acceptor disubstituted diarylethene derivatives with oxidized thiophene rings
Katsuki Okuno; Yasuteru Shigeta; Ryohei Kishi; Masayoshi Nakano
Physical Chemistry Chemical Physics 17: 6484 (2015) Semantic Scholar
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342.
Simple, yet powerful methodologies for conformational sampling of proteins
Ryuhei Harada; Yu Takano; Takeshi Baba; Yasuteru Shigeta
Physical Chemistry Chemical Physics 17: 6155 (2015) Semantic Scholar
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343.
A QM/MM study of the initial steps of catalytic mechanism of nitrile hydratase
Megumi Kayanuma; Kyohei Hanaoka; Mitsuo Shoji; Yasuteru Shigeta
Chemical Physics Letters 623: 8 (2015) Semantic Scholar
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344.
液体の積分方程式を用いたタンパク質中アミノ酸のpKa予測手法の開発
笠井, 友佳子; 吉田, 紀生; 松井, 亨; 重田, 育照中野, 晴之
日本物理学会講演概要集 70: 3238 (2015)
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345.
第一原理計算によるタンパク質のpK_aと構造機能相関
重田,育照; 松井,亨
日本物理学会講演概要集 70: 3258 (2015)
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346.
酵素による人工物質の分解反応シミュレーション
神谷克政; 重田,育照
Journal of the Japan Society for Simulation Technology 34: 6 (2015)
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347.
Substitution effects on optical properties of iminonitroxide-substituted iminonitroxide diradical
Ryota Nakamura; Yasuteru Shigeta; Katsuki Okuno; Miki Hasegawa (+4 著者) Masayoshi Nakano
Molecular Physics 113: 267 (2015) Semantic Scholar
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348.
Hydration effects on enzyme-substrate complex of nylon oligomer hydrolase: Inter-fragment interaction energy study by the fragment molecular orbital method
Hiroyuki Ando; Yasuteru Shigeta; Takeshi Baba; Chiduru Watanabe (+2 著者) Masayoshi Nakano
Molecular Physics 113: 319 (2015) Semantic Scholar
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349.
Unraveling the degradation of artificial amide bonds in nylon oligomer hydrolase: From induced-fit to acylation processes
Takeshi Baba; Mauro Boero; Katsumasa Kamiya; Hiroyuki Ando (+2 著者) Yasuteru Shigeta
Physical Chemistry Chemical Physics 17: 4492 (2015) Semantic Scholar
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350.
Quantal cumulant dynamics for real-time simulations of quantum many-body systems
Yasuteru Shigeta; Ryuhei Harada; Megumi Kayanuma; Mitsuo Shoji
International Journal of Quantum Chemistry 115: 300 (2015) Semantic Scholar
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351.
Protein folding pathways extracted by OFLOOD: Outlier flooding method
Ryuhei Harada; Tomotake Nakamura; Yu Takano; Yasuteru Shigeta
Journal of Computational Chemistry 36: 97 (2015) Semantic Scholar
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352.
Accurate Standard Hydrogen Electrode Potential and Applications to the Redox Potentials of Vitamin C and NAD/NADH
Toru Matsui; Yasutaka Kitagawa; Mitsutaka Okumura; Yasuteru Shigeta
Journal of Physical Chemistry A 119: 369 (2015) Semantic Scholar
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353.
OpenFMOにおける4中心クーロン相互作用項計算のGPGPU化の試み
梅田, 宏明; 塙, 敏博; 庄司, 光男; 朴, 泰祐重田, 育照
Journal of Chemical Software 14: 69 (2015)
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354.
GPGPUクラスタ上でのFMO計算の性能評価
梅田, 宏明; 塙, 敏博; 庄司, 光男; 朴, 泰祐重田, 育照
Journal of Chemical Software 13: 323 (2015)
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355.
Protein Folding Pathways Extracted by OFLOOD: Outlier FLOODing Method
Ryuhei Harada; Tomotake Nakamura; Yu Takano; Yasuteru Shigeta
JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY 36: 97 (2015) Semantic Scholar
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356.
OpenFMOプログラムのGPGPU化
梅田宏明; 塙敏博; 庄司光男; 朴泰祐重田育照
分子科学討論会講演プログラム&要旨(Web) 9th: ROMBUNNO.2P115 (WEB (2015)
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357.
OpenFMOにおける4中心クーロン相互作用項計算のGPGPU化の試み
梅田宏明; 塙敏博; 庄司光男; 朴泰祐重田育照
日本コンピュータ化学会年会講演予稿集 2015: 53 (2015)
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358.
Static electric field effect on third-order nonlinear optical (NLO) properties of singlet diradical molecules: Toward the realization of an electric field induced open-shell NLO switch
Masayoshi Nakano; Takuya Minami; Hitoshi Fukui; Kyohei Yoneda (+5 著者) Takashi Kubo
AIP Conference Proceedings 1642: 477 (2015) Semantic Scholar
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359.
A density functional study on the pK
a of small polyprotic molecules Takeshi Baba; Toru Matsui; Katsumasa Kamiya; Masayoshi NakanoYasuteru ShigetaInternational Journal of Quantum Chemistry 114: 1128 (2014) Semantic Scholar -
360.
Open-shell character and second hyperpolarizabilities of one-dimensional chromium(II) chains: Size dependence and bond-length alternation effect
Hitoshi Fukui; Shota Takamuku; Taishi Yamada; Kotaro Fukuda (+4 著者) Masayoshi Nakano
Inorganic Chemistry 53: 8700 (2014) Semantic Scholar
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1.
Hydrogenomics: The Science of Fully Utilizing Hydrogen
Hori, Yuta; Nishikawa, Koji; Shigeta, Yasuteru; Higuchi, Yoshiki
共立出版 2023年4月
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2.
Recent advances of the fragment molecular orbital method Subtitle: Enhanced performance and applicability
Shigeta, Yasuteru
(担当:分担執筆, 範囲:AnalysisFMO toolkit: PyMOL plugin module to 3D-visualize interaction energies in protein (3D-VIEP) generated by fragment molecular orbital calculation)
Springer 2021年1月 (ISBN: 9789811592355)
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3.
Recent advances of the fragment molecular orbital method Subtitle: Enhanced performance and applicability
Shigeta, Yasuteru
(担当:分担執筆, 範囲:AnalysisFMO toolkit: PyMOL plugin module to 3D-visualize interaction energies in protein (3D-VIEP) generated by fragment molecular orbital calculation)
Springer 2021年1月 (ISBN: 9789811592355)
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4.
Advances in Quantum Chemistry
Shigeta, Yasuteru; Harada, Ryuhei
(担当:分担執筆, 範囲:Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Simulations for Transition Pathway Sampling of Biomolecules)
2019年1月
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5.
Quantum Systems in Physics, Chemistry, and Biology: Advances in Concepts and Applications
Baba, Takeshi; Kamiya, Katsumasa; Shigeta, Yasuteru
(担当:分担執筆, 範囲:Integrated Computational Studies on Mutational Effects of A Nylon-degrading Enzyme)
2017年6月 (ISBN: 9783319502540)
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6.
Reference modules in Materials Science and Engineering 2016
Harada, Ryuhei; Inagaki, Yuji; Shigeta, Yasuteru
(担当:分担執筆, 範囲:Protein Folding and Evolution)
2016年6月
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7.
金属錯体の量子・計算化学
重田,育照; 北河康隆
(担当:分担執筆, 範囲:第4-1章 錯体の伝導性)
2014年10月
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8.
Quantum mechanics Chap. 17
Shigeta,Yasuteru
(担当:分担執筆, 範囲:Quantal Cumulant Mechanics as Extended Ehrenfest Theorem)
InTech open 2013年4月
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9.
Conceptual and Computational Advances in Quantum Chemistry, Chap. 25
Shigeta,Yasuteru
(担当:分担執筆, 範囲:Theoretical Studies on Metal-Containing Artificial DNA Bases”, Advances in the Theory of Atomic and Molecular Systems)
Springer 2012年10月
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10.
Advances in the Theory of Atomic and Molecular Systems, Conceptual and Computational Advances in Quantum Chemistry, Chap. 21
Shigeta,Yasuteru
(担当:分担執筆, 範囲:Quantum Theory in Terms of Cumulant Variables)
Springer 2009年10月
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11.
ADVANCES IN THE THEORY OF ATOMIC AND MOLECULAR SYSTEMS: DYNAMICS, SPECTROSCOPY, CLUSTERS, AND NANOSTRUCTURES
Shigeta, Yasuteru; Miyachi, Hideaki; Matsui, Toru; Yokoyama, Norisuke; Hirao, Kimihiko
(担当:分担執筆, 範囲:Quantum Theory in Terms of Cumulant Variables)
SPRINGER 2009年1月 (ISBN: 9789048129843)
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12.
Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics, Chap. 2
Shigeta,Yasuteru
(担当:分担執筆, 範囲:Single-Reference Methods for Excited States in Molecules and Polymers)
Springer 2008年10月
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13.
物性量子化学入門
重田,育照
(担当:分担執筆, 範囲:第13、14章)
講談社 2004年9月
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1.
理論計算による生体内水素機能メカニズムの解明
堀, 優太; 重田, 育照
第32回日本MRS年次大会 2022年12月5日 招待有り
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2.
自閉症関連Hevin/Sparcl1変異体は構造不安定性を介して小胞体ストレスを誘導する
武富, 巧; 保田, 拓範; 森田, 陸離; 重田, 育照; 原田, 隆平; 鶴田, 文憲
第45回日本分子生物学会 2022年11月30日
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3.
Chiral symmetry breaking for amino acid homochirality by dimerization
渡辺, 七都稀; 庄司光男; 堀, 優太; 重田, 育照
Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
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4.
heoretical prediction into a possibility of the formation of propylene oxide homochirality
堀, 優太; 渡辺, 七都稀; 庄司光男; 重田, 育照
Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
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5.
有機分子触媒を用いたアミノ酸ラセミ化反応の理論的研究
渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
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6.
分子動力学計算に基づくシロイヌナズナおよびエンバクHPPD-メソトリオン複合体の結合挙動解析
宗井, 陽平; 堀, 優太; Hengphasatporn, Kowi; 原田, 隆平; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
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7.
高電位鉄硫黄タンパク質の電子状態と周辺アミノ酸からの影響
堀, 優太; 佐藤, 綾香; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
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8.
化学反応ネットワークと機械学習による生成物および反応経路予測の可能性
佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
第45回ケモインフォマティクス討論会 2022年11月18日
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9.
ヒト型アルギニンメチル化酵素PRMT1遺伝子改変マウスの作出とその解析
姚遠; 加香孝一郎; Kowit, Hengphasatporn; 重田育照; 本村香織; 金俊達; 深水, 昭吉
第95回日本生化学会会 2022年11月9日
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10.
Theoretical characterization of the active site and its formation pathway in oxidized [NiFe]-hydrogenase
堀, 優太; 重田, 育照
第60回 日本生物物理学会年会 2022年9月28日 日本生物物理学会
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11.
高電位鉄硫黄タンパク質の鉄硫黄クラスターの電子状態と周囲のアミノ酸からの影響の理論解析
佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
第16回分子科学討論会 2022年9月19日
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12.
Hydrogen bond structures and dynamics in proton-conducting imidazolium hydrogen succinate
Hori, Yuta; Dekura, Shun; Mori, Hatsumi; Shigeta, Yasuteru
24th International Conference On Horizons In Hydrogen Bond Research (HBond2022) 2022年9月12日
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13.
高電位鉄硫黄タンパク質のクラスター周辺の構造が及ぼす影響と電子状態についての理論的解析
佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
物性研短期研究会、理論タンパク質物性科学の最前線:理論と実験との密な協働 2022年7月26日
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14.
酸化型[Ni-Fe]ヒドロゲナーゼの活性中心についての理論的研究
堀, 優太; 重田, 育照
物性研短期研究会、理論タンパク質物性科学の最前線:理論と実験との密な協働 2022年7月26日
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15.
Integrated experimental-theoretical approaches to decipher how H179Y substitution affects the biological functions of PRMT1
Yao, Yuan; Jun-Dal, Kim; Hiroaki, Daitoku; Naoto, Muromachi; Koichiro, Kako; Junji, Ishida; KowitHengphasatporn; Yasuteru, Shigeta; 深水, 昭吉
2022年度日本生化学会関東支部例会 2022年6月18日
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16.
高電位鉄硫黄タンパク質の[4Fe-4S]活性中心の構造と電子状態についての理論的解析
堀, 優太; 佐藤, 綾香; 重田, 育照
第22回日本蛋白質科学会年会 2022年6月7日
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17.
高電位鉄硫黄タンパク質の鉄硫黄クラスター周辺の構造と電子状態についての理論的解析
佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
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18.
アミノ酸ホモキラリティ起源を紐解く結晶形成過程についての量子化学研究
渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
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19.
酸化型[NiFe]ヒドロゲナーゼの生成過程と活性中心の構造についての理論的研究
堀, 優太; 重田, 育照
第24回理論化学討論会 2022年5月17日
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20.
Theoretical Study on the Active Site in Oxidized [NiFe]-Hydrogenase
堀, 優太; 重田, 育照
2nd International Symposium “Hydrogenomics” 2022年5月16日
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1. 15/228,873: Information Processing Apparatus and Simulation Method
重田, 育照 -
2. 15/228,540: Information Processing Apparatus and Simulation Method
重田,育照 -
3. 2015-156703: 情報処理装置、指標次元抽出方法、および指標次元抽出プログラム
重田,育照 -
4. 2015-156702: 情報処理装置、シミュレーション方法、およびシミュレーションプログ 2. ラム
重田,育照 -
5. 2015-032321: 情報処理、シミュレーションプログラムおよびシミュレーション方法
重田,育照
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