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重田育照

Shigeta, Yasuteru

計算科学研究センター , 教授
Center for Computational Sciences , Professor

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41. Integrated In-Silico Drug Modeling for Viral Proteins Kowit Hengphasatporn; Yasuteru Shigeta
(2024)
42. Synthesis and biological evaluation of 2'-hydroxychalcone derivatives as AMPK activators. Duy Vu Nguyen; Chatchai Muanprasat; Suchada Kaewin; Kowit Hengphasatporn (+2 著者) Warinthorn Chavasiri
Bioorganic chemistry 143: 107048 (2023) Semantic Scholar
43. Pathological mutations promote proteolysis of mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1 (MTU1) via mitochondrial caseinolytic peptidase (CLPP). Raja Norazireen Raja Ahmad; Long-Teng Zhang; Rikuri Morita; Haruna Tani (+6 著者) Fan-Yan Wei
Nucleic acids research (2023) Semantic Scholar
44. Structural and thermodynamic insights into antibody light chain tetramer formation through 3D domain swapping. Takahiro Sakai; Tsuyoshi Mashima; Naoya Kobayashi; Hideaki Ogata (+6 著者) Shun Hirota
Nature communications 14: 7807 (2023) Semantic Scholar
45. Assessment of the applicability of the LFC/3D-RISM-SCF scheme for pKa prediction in methanol solutions Ryo Fujiki; Toru Matsui; Yasuteru Shigeta; Norio YoshidaHaruyuki Nakano
Chemistry Letters 53: (2023) Semantic Scholar
46. The 8-bromobaicalein alleviated chikungunya-induced musculoskeletal inflammation and reduced the viral load in healthy adult mice Cao, Van; Loeanurit, Napha; Hengphasatporn, Kowi; Hairani, Rita (+7 著者) Boonyasuppayakorn, Siwaporn
EMERGING MICROBES & INFECTIONS 12: (2023) Semantic Scholar
47. Combining AI-based Modeling and Flexible Docking for Efficient Refinement of Protein-RNA Complexes using PaCS-MD Hengphasatporn, Kowi; Nitchakan, Darai; Harada, Ryuhei; Shigeta, Yasuteru
PROTEIN SCIENCE 32: (2023)
48. A sulfonamide chalcone inhibited dengue virus with a potential target at the SAM-binding site of viral methyltransferase. Van Cao; I Putu Sukanadi; Naphat Loeanurit; Aphinya Suroengrit (+5 著者) Siwaporn Boonyasuppayakorn
Antiviral research 220: 105753 (2023) Semantic Scholar
49. The 8-bromobaicalein inhibited the replication of dengue, and Zika viruses and targeted the dengue polymerase Siwaporn Boonyasuppayakorn; Thanaphon Saelee; Thao Nguyen Thanh Huynh; Rita Hairani (+12 著者) Warinthorn Chavasiri
Scientific Reports 13: (2023) Semantic Scholar
50. Deciphering the Potential of Multidimensional Carbon Materials for Surface-Enhanced Raman Spectroscopy through Density Functional Theory Xuke Tang; Naoki Kishimoto; Yasutaka Kitahama; Ting-Ting You (+4 著者) Keisuke Goda
The Journal of Physical Chemistry Letters (2023) Semantic Scholar
51. Structure-yeast α-glucosidase inhibitory activity relationship of 9-O-berberrubine carboxylates. Duy Vu Nguyen; Kowit Hengphasatporn; Ade Danova; Aphinya Suroengrit (+4 著者) Warinthorn Chavasiri
Scientific reports 13: 18865 (2023) Semantic Scholar
52. Latrunculin resistance mechanism of non-conventional actin NAP1 uncovered by molecular dynamics simulations Morita, Rikuri; Shigeta, Yasuteru; Harada, Ryuhei
CYTOSKELETON Epub: (2023) Semantic Scholar
53. Origin of Homochirality in Amino Acids Induced by Lyman-α Irradiation in the Early Stage of the Milky Way Sato, Akimasa; Shoji, Mitsuo; Watanabe, Natsuki; Boero, Mauro (+1 著者) Umemura, Masayuki
ASTROBIOLOGY 23: 1019 (2023) Semantic Scholar
54. Neutron Crystallography of a Semiquinone Radical Intermediate of Copper Amine Oxidase Reveals a Substrate-Assisted Conformational Change of the Peptidyl Quinone Cofactor Takeshi Murakawa; Kazuo Kurihara; Mitsuo Shoji; Naomine Yano (+7 著者) Toshihide Okajima
ACS Catalysis 12403 (2023) Semantic Scholar
55. Development of an Iron(II) Complex Exhibiting Thermal- and Photoinduced Double Proton-Transfer-Coupled Spin Transition in a Short Hydrogen Bond Takumi Nakanishi; Yuta Hori; Yasuteru Shigeta; Hiroyasu Sato (+6 著者) Osamu Sato
Journal of the American Chemical Society (2023) Semantic Scholar
56. Identification of Promising Sulfonamide Chalcones as Inhibitors of SARS-CoV-2 3CL^pro through Structure-Based Virtual Screening and Experimental Approaches Pojtanadithee, Piyatida; Hengphasatporn, Kowi; Suroengrit, Aphinya; Boonyasuppayakorn, Siwaporn (+11 著者) Thanyada
JOURNAL OF CHEMICAL INFORMATION AND MODELING Epub: (2023) Semantic Scholar
57. A Structural Refinement Technique for Protein-RNA Complexes Based on a Combination of AI-based Modeling and Flexible Docking: A Study of Musashi-1 Protein Nitchakan Darai; Kowit Hengphasatporn; Peter Wolschann; Michael T. Wolfinger (+2 著者) Ryuhei Harada
Bulletin of the Chemical Society of Japan 96: 677 (2023) Semantic Scholar
58. Designing Potent α-Glucosidase Inhibitors: A Synthesis and QSAR Modeling Approach for Biscoumarin Derivatives Thi-Hong-Truc Phan; Kowit Hengphasatporn; Yasuteru Shigeta; Wanting Xie (+2 著者) Warinthorn Chavasiri
ACS Omega 8: 26340 (2023) Semantic Scholar
59. 1T/1H-SnS₂ Sheets for Electrochemical CO₂ Reduction to Formate Kawabe, Yusuke; Ito, Yoshikazu; Hori, Yuta; Kukunuri, Suresh (+7 著者) Takahashi, Yasufumi
ACS nano 17: 11318 (2023)
60. Determination of the Association between Mesotrione Sensitivity and Conformational Change of 4-Hydroxyphenylpyruvate Dioxygenase via Free-Energy Analyses Munei, Yohei; Hengphasatporn, Kowi; Hori, Yuta; Harada, RyuheiShigeta, Yasuteru
Journal of agricultural and food chemistry 71: 9528 (2023) Semantic Scholar

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1. Hydrogenomics: The Science of Fully Utilizing Hydrogen Hori, Yuta; Nishikawa, Koji; Shigeta, Yasuteru; Higuchi, Yoshiki
共立出版 2023年4月
2. Recent advances of the fragment molecular orbital method Subtitle: Enhanced performance and applicability Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:AnalysisFMO toolkit: PyMOL plugin module to 3D-visualize interaction energies in protein (3D-VIEP) generated by fragment molecular orbital calculation)
Springer 2021年1月 (ISBN: 9789811592355)
3. Recent advances of the fragment molecular orbital method Subtitle: Enhanced performance and applicability Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:AnalysisFMO toolkit: PyMOL plugin module to 3D-visualize interaction energies in protein (3D-VIEP) generated by fragment molecular orbital calculation)
Springer 2021年1月 (ISBN: 9789811592355)
4. Advances in Quantum Chemistry Shigeta, Yasuteru; Harada, Ryuhei (担当:分担執筆, 範囲:Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Simulations for Transition Pathway Sampling of Biomolecules)
2019年1月
5. Quantum Systems in Physics, Chemistry, and Biology: Advances in Concepts and Applications Baba, Takeshi; Kamiya, Katsumasa; Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Integrated Computational Studies on Mutational Effects of A Nylon-degrading Enzyme)
2017年6月 (ISBN: 9783319502540)
6. Reference modules in Materials Science and Engineering 2016 Harada, Ryuhei; Inagaki, Yuji; Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Protein Folding and Evolution)
2016年6月
7. 金属錯体の量子・計算化学重田,育照; 北河康隆 (担当:分担執筆, 範囲:第4-1章錯体の伝導性)
2014年10月
8. Quantum mechanics Chap. 17 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Quantal Cumulant Mechanics as Extended Ehrenfest Theorem)
InTech open 2013年4月
9. Conceptual and Computational Advances in Quantum Chemistry, Chap. 25 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Theoretical Studies on Metal-Containing Artificial DNA Bases”, Advances in the Theory of Atomic and Molecular Systems)
Springer 2012年10月
10. Advances in the Theory of Atomic and Molecular Systems, Conceptual and Computational Advances in Quantum Chemistry, Chap. 21 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Quantum Theory in Terms of Cumulant Variables)
Springer 2009年10月
11. ADVANCES IN THE THEORY OF ATOMIC AND MOLECULAR SYSTEMS: DYNAMICS, SPECTROSCOPY, CLUSTERS, AND NANOSTRUCTURES Shigeta, Yasuteru; Miyachi, Hideaki; Matsui, Toru; Yokoyama, Norisuke; Hirao, Kimihiko (担当:分担執筆, 範囲:Quantum Theory in Terms of Cumulant Variables)
SPRINGER 2009年1月 (ISBN: 9789048129843)
12. Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics, Chap. 2 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Single-Reference Methods for Excited States in Molecules and Polymers)
Springer 2008年10月
13. 物性量子化学入門重田,育照 (担当:分担執筆, 範囲:第１３、１４章)
講談社 2004年9月

1. 理論計算による生体内水素機能メカニズムの解明堀, 優太; 重田, 育照
第32回日本MRS年次大会 2022年12月5日招待有り
2. 自閉症関連Hevin/Sparcl1変異体は構造不安定性を介して小胞体ストレスを誘導する武富, 巧; 保田, 拓範; 森田, 陸離; 重田, 育照; 原田, 隆平; 鶴田, 文憲
第45回日本分子生物学会 2022年11月30日
3. Chiral symmetry breaking for amino acid homochirality by dimerization 渡辺, 七都稀; 庄司光男; 堀, 優太; 重田, 育照
Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
4. heoretical prediction into a possibility of the formation of propylene oxide homochirality 堀, 優太; 渡辺, 七都稀; 庄司光男; 重田, 育照
Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
5. 有機分子触媒を用いたアミノ酸ラセミ化反応の理論的研究渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
6. 分子動力学計算に基づくシロイヌナズナおよびエンバクHPPD-メソトリオン複合体の結合挙動解析宗井, 陽平; 堀, 優太; Hengphasatporn, Kowi; 原田, 隆平; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
7. 高電位鉄硫黄タンパク質の電子状態と周辺アミノ酸からの影響堀, 優太; 佐藤, 綾香; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
8. 化学反応ネットワークと機械学習による生成物および反応経路予測の可能性佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
第45回ケモインフォマティクス討論会 2022年11月18日
9. ヒト型アルギニンメチル化酵素PRMT1遺伝子改変マウスの作出とその解析姚遠; 加香孝一郎; Kowit, Hengphasatporn; 重田育照; 本村香織; 金俊達; 深水, 昭吉
第95回日本生化学会会 2022年11月9日
10. Theoretical characterization of the active site and its formation pathway in oxidized [NiFe]-hydrogenase 堀, 優太; 重田, 育照
第60回日本生物物理学会年会 2022年9月28日日本生物物理学会
11. 高電位鉄硫黄タンパク質の鉄硫黄クラスターの電子状態と周囲のアミノ酸からの影響の理論解析佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
第16回分子科学討論会 2022年9月19日
12. Hydrogen bond structures and dynamics in proton-conducting imidazolium hydrogen succinate Hori, Yuta; Dekura, Shun; Mori, Hatsumi; Shigeta, Yasuteru
24th International Conference On Horizons In Hydrogen Bond Research (HBond2022) 2022年9月12日
13. 高電位鉄硫黄タンパク質のクラスター周辺の構造が及ぼす影響と電子状態についての理論的解析佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
物性研短期研究会、理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働 2022年7月26日
14. 酸化型[Ni-Fe]ヒドロゲナーゼの活性中心についての理論的研究堀, 優太; 重田, 育照
物性研短期研究会、理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働 2022年7月26日
15. Integrated experimental-theoretical approaches to decipher how H179Y substitution affects the biological functions of PRMT1 Yao, Yuan; Jun-Dal, Kim; Hiroaki, Daitoku; Naoto, Muromachi; Koichiro, Kako; Junji, Ishida; KowitHengphasatporn; Yasuteru, Shigeta; 深水, 昭吉
2022年度日本生化学会関東支部例会 2022年6月18日
16. 高電位鉄硫黄タンパク質の[4Fe-4S]活性中心の構造と電子状態についての理論的解析堀, 優太; 佐藤, 綾香; 重田, 育照
第22回日本蛋白質科学会年会 2022年6月7日
17. 高電位鉄硫黄タンパク質の鉄硫黄クラスター周辺の構造と電子状態についての理論的解析佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
18. アミノ酸ホモキラリティ起源を紐解く結晶形成過程についての量子化学研究渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
19. 酸化型[NiFe]ヒドロゲナーゼの生成過程と活性中心の構造についての理論的研究堀, 優太; 重田, 育照
第24回理論化学討論会 2022年5月17日
20. Theoretical Study on the Active Site in Oxidized [NiFe]-Hydrogenase 堀, 優太; 重田, 育照
2nd International Symposium “Hydrogenomics” 2022年5月16日