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重田育照

Shigeta, Yasuteru

計算科学研究センター , 教授
Center for Computational Sciences , Professor

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61. Sulfonylated Indeno[1,2-c]quinoline Derivatives as Potent EGFR Tyrosine Kinase Inhibitors Hengphasatporn, Kowi; Aiebchun, Thitinan; Mahalapbutr, Panupong; Auepattanapong, Atima (+6 著者) Thanyada
ACS omega 8: 19645 (2023) Semantic Scholar
62. Finite temperature effects on the structural stability of Si-doped HfO₂ using first-principles calculations Harashima, Y; Koga, H; Ni, Z; Yonehara, T (+7 著者) Shigeta, Y
APPLIED PHYSICS LETTERS 122: (2023) Semantic Scholar
63. A Variety of Initial Velocities in Restarting Molecular Dynamics Simulations Promotes Protein Transitions Yohei Munei; Yasuteru Shigeta; Ryuhei Harada
Chemistry Letters, 52: 385 (2023) Semantic Scholar
64. Enantioselective Amino Acid interactions in Solution Watanabe, Natsuki; Shoji, Mitsuo; Miyagawa, Koichi; Hori, Yuta (+2 著者) Shigeta, Yasuteru
PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS 25: 15023 (2023) Semantic Scholar
65. Helical Organic and Inorganic Polymers So Hirata; Yasuteru Shigeta; Sotiris S. Xantheas; Rodney J. Bartlett
The Journal of Physical Chemistry B (2023) Semantic Scholar
66. Enantiomeric Excesses of Aminonitrile Precursors Determine the Homochirality of Amino Acids Mitsuo Shoji; Yuya Kitazawa; Akimasa Sato; Natsuki Watanabe (+2 著者) Masayuki Umemura
The Journal of Physical Chemistry Letters (2023) Semantic Scholar
67. In silico screening of chalcones and flavonoids as potential inhibitors against yellow head virus 3C-like protease Boonthaworn, Kanpong; Hengphasatporn, Kowi; Shigeta, Yasuteru; Chavasiri, Warinthorn (+1 著者) Ounjai, Puey
PEERJ 11: e15086 (2023) Semantic Scholar
68. Pocket to concavity: a tool for the refinement of protein-ligand binding site shape from alpha spheres Kudo, Genki; Hirao, Takumi; Yoshino, Ryunosuke; Shigeta, Yasuteru (+1 著者) Takatsugu
BIOINFORMATICS 39: (2023) Semantic Scholar
69. Organocatalytic-racemization reaction elucidation of aspartic acid by density functional theory Watanabe, Natsuki; Hori, Yuta; Shoji, Mitsuo; Boero, MauroShigeta, Yasuteru
CHIRALITY 35: 645 (2023) Semantic Scholar
70. Observation of proton-transfer-coupled spin transition by single-crystal neutron-diffraction measurement Nakanishi, Takumi; Hori, Yuta; Shigeta, Yasuteru; Sato, Hiroyasu (+4 著者) Osamu, Sato
Physical Chemistry Chemical Physics 25: 12394 (2023) Semantic Scholar
71. Biological advantage of the arrangements of C-phycocyanin chromophores in phycobilisome from the electronic energy transfer viewpoint Mishima, Kenji; Shoji, Mitsuo; Umena, Yasufumi; Shigeta, Yasuteru
BULLETIN OF THE CHEMICAL SOCIETY OF JAPAN 96: 381 (2023) Semantic Scholar
72. Deprotonation-Induced and Ion-Pairing-Modulated Diradical Properties of Partially Conjugated Pyrrole–Quinone Conjunction Shinya Sugiura; Takashi Kubo; Yohei Haketa; Yuta Hori (+3 著者) Hiromitsu Maeda
Journal of the American Chemical Society 145: 8122 (2023) Semantic Scholar
73. Efficient screening of protein-ligand complexes in lipid bilayers using LoCoMock score. Rikuri Morita; Yasuteru Shigeta; Ryuhei Harada
Journal of computer-aided molecular design (2023) Semantic Scholar
74. 有機分子触媒を用いたアミノ酸ラセミ化反応の理論的研究渡辺, 七都稀; 堀, 優太; 庄司, 光男; 重田, 育照
Journal of Computer Chemistry, Japan 21: 80 (2023) Semantic Scholar
75. 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase (HPPD)における金属活性中心の力場パラメータの構築とその評価宗井, 陽平; 堀, 優太; Kowit, Hengphasatporn; 原田, 隆平重田, 育照
Journal of Computer Chemistry, Japan 21: 82 (2023) Semantic Scholar
76. Theoretical Characterization of the Electronic and Spin Structures for Iron–Sulfur Cubane in Reduced High-Potential Iron–Sulfur Proteins Using Density Functional Theory Hori, Yuta; Sato, Ayaka; Yasuteru, Shigeta
Journal of Computer Chemistry, Japan 21: 77 (2023) Semantic Scholar
77. シトクロムcの複合体形成過程の再現シミュレーション下山紘充; 重田, 育照
Journal of Computer Chemistry Japan 21: 134 (2023) Semantic Scholar
78. X‐ray crystallographic and mutational analysis of the NylC precursor: Catalytic mechanism of autocleavage and substrate hydrolysis of nylon hydrolase Seiji Negoro; Naoki Shibata; Dai‐ichiro Kato; Yusuke Tanaka (+10 著者) Yoshiki Higuchi
The FEBS Journal (2023) Semantic Scholar
79. Theoretical Study on the Regulating Mechanism of the Transition Between the Open-closed State of hCtBP2: A Combined Molecular Dynamics and Quantum Mechanical Interaction Analysis Yamamoto, Yuta; Shigeta, Yasuteru
CHEMISTRY LETTERS 52: 120 (2023) Semantic Scholar
80. Design of electron-donating group substituted 2-PAM analogs as antidotes for organophosphate insecticide poisoning Nalinee Kongkaew; Kowit Hengphasatporn; Yuwanda Injongkol; Pitchayathida Mee-udorn (+6 著者) Alisa S. Vangnai
RSC Advances 13: 32266 (2023) Semantic Scholar

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1. Hydrogenomics: The Science of Fully Utilizing Hydrogen Hori, Yuta; Nishikawa, Koji; Shigeta, Yasuteru; Higuchi, Yoshiki
共立出版 2023年4月
2. Recent advances of the fragment molecular orbital method Subtitle: Enhanced performance and applicability Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:AnalysisFMO toolkit: PyMOL plugin module to 3D-visualize interaction energies in protein (3D-VIEP) generated by fragment molecular orbital calculation)
Springer 2021年1月 (ISBN: 9789811592355)
3. Recent advances of the fragment molecular orbital method Subtitle: Enhanced performance and applicability Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:AnalysisFMO toolkit: PyMOL plugin module to 3D-visualize interaction energies in protein (3D-VIEP) generated by fragment molecular orbital calculation)
Springer 2021年1月 (ISBN: 9789811592355)
4. Advances in Quantum Chemistry Shigeta, Yasuteru; Harada, Ryuhei (担当:分担執筆, 範囲:Parallel Cascade Selection Molecular Dynamics Simulations for Transition Pathway Sampling of Biomolecules)
2019年1月
5. Quantum Systems in Physics, Chemistry, and Biology: Advances in Concepts and Applications Baba, Takeshi; Kamiya, Katsumasa; Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Integrated Computational Studies on Mutational Effects of A Nylon-degrading Enzyme)
2017年6月 (ISBN: 9783319502540)
6. Reference modules in Materials Science and Engineering 2016 Harada, Ryuhei; Inagaki, Yuji; Shigeta, Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Protein Folding and Evolution)
2016年6月
7. 金属錯体の量子・計算化学重田,育照; 北河康隆 (担当:分担執筆, 範囲:第4-1章錯体の伝導性)
2014年10月
8. Quantum mechanics Chap. 17 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Quantal Cumulant Mechanics as Extended Ehrenfest Theorem)
InTech open 2013年4月
9. Conceptual and Computational Advances in Quantum Chemistry, Chap. 25 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Theoretical Studies on Metal-Containing Artificial DNA Bases”, Advances in the Theory of Atomic and Molecular Systems)
Springer 2012年10月
10. Advances in the Theory of Atomic and Molecular Systems, Conceptual and Computational Advances in Quantum Chemistry, Chap. 21 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Quantum Theory in Terms of Cumulant Variables)
Springer 2009年10月
11. ADVANCES IN THE THEORY OF ATOMIC AND MOLECULAR SYSTEMS: DYNAMICS, SPECTROSCOPY, CLUSTERS, AND NANOSTRUCTURES Shigeta, Yasuteru; Miyachi, Hideaki; Matsui, Toru; Yokoyama, Norisuke; Hirao, Kimihiko (担当:分担執筆, 範囲:Quantum Theory in Terms of Cumulant Variables)
SPRINGER 2009年1月 (ISBN: 9789048129843)
12. Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics, Chap. 2 Shigeta,Yasuteru (担当:分担執筆, 範囲:Single-Reference Methods for Excited States in Molecules and Polymers)
Springer 2008年10月
13. 物性量子化学入門重田,育照 (担当:分担執筆, 範囲:第１３、１４章)
講談社 2004年9月

1. 理論計算による生体内水素機能メカニズムの解明堀, 優太; 重田, 育照
第32回日本MRS年次大会 2022年12月5日招待有り
2. 自閉症関連Hevin/Sparcl1変異体は構造不安定性を介して小胞体ストレスを誘導する武富, 巧; 保田, 拓範; 森田, 陸離; 重田, 育照; 原田, 隆平; 鶴田, 文憲
第45回日本分子生物学会 2022年11月30日
3. Chiral symmetry breaking for amino acid homochirality by dimerization 渡辺, 七都稀; 庄司光男; 堀, 優太; 重田, 育照
Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
4. heoretical prediction into a possibility of the formation of propylene oxide homochirality 堀, 優太; 渡辺, 七都稀; 庄司光男; 重田, 育照
Symposium on Next Generation Astrochemistry 2022 2022年11月29日
5. 有機分子触媒を用いたアミノ酸ラセミ化反応の理論的研究渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
6. 分子動力学計算に基づくシロイヌナズナおよびエンバクHPPD-メソトリオン複合体の結合挙動解析宗井, 陽平; 堀, 優太; Hengphasatporn, Kowi; 原田, 隆平; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
7. 高電位鉄硫黄タンパク質の電子状態と周辺アミノ酸からの影響堀, 優太; 佐藤, 綾香; 重田, 育照
日本コンピュータ化学会2022年秋季年会 2022年11月25日
8. 化学反応ネットワークと機械学習による生成物および反応経路予測の可能性佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
第45回ケモインフォマティクス討論会 2022年11月18日
9. ヒト型アルギニンメチル化酵素PRMT1遺伝子改変マウスの作出とその解析姚遠; 加香孝一郎; Kowit, Hengphasatporn; 重田育照; 本村香織; 金俊達; 深水, 昭吉
第95回日本生化学会会 2022年11月9日
10. Theoretical characterization of the active site and its formation pathway in oxidized [NiFe]-hydrogenase 堀, 優太; 重田, 育照
第60回日本生物物理学会年会 2022年9月28日日本生物物理学会
11. 高電位鉄硫黄タンパク質の鉄硫黄クラスターの電子状態と周囲のアミノ酸からの影響の理論解析佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
第16回分子科学討論会 2022年9月19日
12. Hydrogen bond structures and dynamics in proton-conducting imidazolium hydrogen succinate Hori, Yuta; Dekura, Shun; Mori, Hatsumi; Shigeta, Yasuteru
24th International Conference On Horizons In Hydrogen Bond Research (HBond2022) 2022年9月12日
13. 高電位鉄硫黄タンパク質のクラスター周辺の構造が及ぼす影響と電子状態についての理論的解析佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
物性研短期研究会、理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働 2022年7月26日
14. 酸化型[Ni-Fe]ヒドロゲナーゼの活性中心についての理論的研究堀, 優太; 重田, 育照
物性研短期研究会、理論タンパク質物性科学の最前線：理論と実験との密な協働 2022年7月26日
15. Integrated experimental-theoretical approaches to decipher how H179Y substitution affects the biological functions of PRMT1 Yao, Yuan; Jun-Dal, Kim; Hiroaki, Daitoku; Naoto, Muromachi; Koichiro, Kako; Junji, Ishida; KowitHengphasatporn; Yasuteru, Shigeta; 深水, 昭吉
2022年度日本生化学会関東支部例会 2022年6月18日
16. 高電位鉄硫黄タンパク質の[4Fe-4S]活性中心の構造と電子状態についての理論的解析堀, 優太; 佐藤, 綾香; 重田, 育照
第22回日本蛋白質科学会年会 2022年6月7日
17. 高電位鉄硫黄タンパク質の鉄硫黄クラスター周辺の構造と電子状態についての理論的解析佐藤, 綾香; 堀, 優太; 重田, 育照
量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
18. アミノ酸ホモキラリティ起源を紐解く結晶形成過程についての量子化学研究渡辺, 七都稀; 庄司, 光男; 堀, 優太; 重田, 育照
量子生命科学会第4回大会 2022年5月26日
19. 酸化型[NiFe]ヒドロゲナーゼの生成過程と活性中心の構造についての理論的研究堀, 優太; 重田, 育照
第24回理論化学討論会 2022年5月17日
20. Theoretical Study on the Active Site in Oxidized [NiFe]-Hydrogenase 堀, 優太; 重田, 育照
2nd International Symposium “Hydrogenomics” 2022年5月16日